建立高分辨熔解曲线分析法检测SF3B1基因突变-江苏大学.PDF

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建立高分辨熔解曲线分析法检测SF3B1基因突变-江苏大学

第23卷第1期 江 苏 大 学 学 报(医学 版) Vol.23 No.1   2013年1月   JournalofJiangsuUniversity(MedicineEdition) Jan.2013             建立高分辨熔解曲线分析法检测SF3B1基因突变 1 1 1 1 1 2 1 杨静 ,姚冬明 ,钱军 ,王翠竹 ,杨小飞 ,林江 ,李云 , 1 2 2 陈星星 ,肖高飞 ,马吉春 (江苏大学附属人民医院1.血液科,2.中心实验室,江苏 镇江212002) [摘要] 目的:建立高分辨熔解曲线分析法(highresolutionmeltinganalysis,HRMA),检测骨髓增生异常综合征(my elodysplasticsyndrome,MDS)患者中SF3B1基因的突变。方法:针对SF3B1基因热点突变位点(密码子E622、H662、 K666和K700)设计PCR扩增引物,建立带有温度内标校准品的PCR扩增反应体系,对30例初诊MDS患者的骨髓标 本进行PCR扩增,应用HRMA对相应PCR产物进行突变检测,并对HRMA检测结果进行DNA测序验证。结果:HR MA检测发现2例MDS患者存在异常的熔解曲线,经DNA测序验证1例为K666M杂合子突变,另1例为K700E杂合 子突变。所建立的HRMA技术检测SF3B1基因突变的灵敏度为0.05(5%)。结论:成功建立检测SF3B1基因突变 的HRMA技术,可快速筛查MDS标本中的SF3B1基因突变。 [关键词] 高分辨率熔解曲线分析;SF3B1;基因突变;骨髓增生异常综合征 [中图分类号] R393  [文献标志码] A  [文章编号] 1671-7783(2013)01-0049-04 DetectionofSF3B1mutationsusinghighresolutionmeltinganalysis 1 1 1 1 1 YANGJing,YAODongming,QIANJun,WANGCuizhu,YANGXiaofei, 2 1 1 2 2 LINJiang,LIYun,CHENXingxing,XIAOGaofei,MAJichun (1.DepartmentofHematology,2.LaboratoryCenter,theAffiliatedPeople′sHospitalofJiangsuUniversity,ZhenjiangJiangsu212002,China) [Abstract] Objective:Toestablishhighresolutionmeltinganalysis(HRMA)assayanddetecttheSF3B1 mutationsinpatientswithmyelodysplasticsyndrome(MDS).Methods:ThePCRamplificationsystemswith internaltemperaturecalibratorswereestablishedwithspecificPCRprimersagainstfourhotspotmutation sitesofSF3B1gene(E622,H662,K666,andK700).ThirtyMDSsampleswereamplif

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