【培训课件】Gaussian软件的使用(频率分析+维里定理+计算模型+化学模型).pptVIP

Gaussian软件的使用 华南农业大学理学院 王炳锋 Gaussian98/03的功能 分子的能量和结构 过渡态的能量和结构 振动频率 红外和拉曼光谱（包括预共振拉曼） 热化学性质 成键和化学反应能量 化学反应路径 分子轨道 原子电荷 电多极矩 NMR 屏蔽和磁化系数 自旋-自旋耦合常数 振动圆二色性强度 电子圆二色性强度 g 张量和超精细光谱的其它张量 旋光性 振动-转动耦合 非谐性的振动分析和振动-转动耦合 电子亲和能和电离势 极化和超极化率（静态的和含频的） 各向异性超精细耦合常数 静电势和电子密度 Gaussian的文件 Gjf 计算任务文件 Chk 临时文件 Rwf 读写文件 Int 双电子积分 D2e 双电子积分导数文件 PDB， ENT MOL， HIN CDX， C3D 运行界面 准备知识 Schrodinger方程 Born-Oppenheimer近似 Hellmann-Feyman定理 维里定理 计算模型 分子力学（Molecular Mechanics） MM+，AMBER，UFF，ComFa等 电子结构模型（Electronic Structure Theory） 半经验方法 从头算 密度泛函 化学模型 计算方法（method） Gaussian 关键词 方法 HF Hartree-Fock 自恰场模型 B3LYP Becke型3 参数密度泛函 型，采用Lee-Yang-Parr 泛函 MP2 二级Moller-Plesset 微扰理论 MP4 四级Moller-Plesset 微扰理论 QCISD(T) 二次CI 基组（basis set） 开壳层，闭壳层 Rational Theoretical Model semiempirical HF MPn (Moller-Plesset) n=2~5 Coupled CLuster Quadratic ConfigurationInteraction Density Functional Theory Methods，DFT 资源的使用 基组的影响 基组是体系内轨道的数学描述。大的基组由于对电子在空间上有小的限制而具有更大的精确性。 用于电子结构计算的标准的基组使用线性的高斯函数来模拟轨道。 最小基组 最小基组包含了描述轨道的最少的函数数量。 H：1s C：1s，2s，2px，2py，2pz STO-3G 是最小基组 分裂基组 增大基组的第一个方法就是增加每个原子基函数的数量。分裂基组，比如3-21G 和6-31G，对于价键轨道都用两个函数来进行描述，比如 H：1s，1s C：1s，2s，2s，2px，2py，2pz，2px，2py，2pz‘ 双zeta 基组，如Dunning-Huzinaga 基组(D95)，采用每个原子的两种不同大小的函数的线性组合来描述分子轨道。同样的，三重分裂基组，如6-311G，采用三个不同大小的收缩函数来描述轨道。 极化基组 分裂基组允许轨道改变其大小，但不能改变形状。极化基组则取消了这样的限制，增加了角动量。 比如在碳原子上增加d 轨道的成分，在过渡金属上增加f 轨道成分。有些在氢原子上增加p 轨道成分 6-31G(d)、6-31G(d，p) 弥散函数(Diffuse Functions) 弥散函数是s 和p 轨道函数的大号的版本。他们允许轨道占据更大的空间。对于电子相对离原子核比较远的体系，如含有孤对电子的体系，负离子，以及其他带有明显负电荷的体系，激发态的体系，含有低的离子化能的体系，以及纯酸的体系等，弥散函数都有重要的应用。 6-31+G(d)基组表示的是6-31G(d)基组在重原子上加上弥散基组，6-31G++(d)基组表示对于氢原子也加上弥散函数。 高角动量基组 6-31G(2d)就是在6-31G 基础上增加两个d 轨道的函数，而6-311++G(3df，3pd)则增加了更多的极化函数，包括三个分裂的价键基组，在重原子和氢原子上加的弥散函数，在重原子上加的三个d 函数和一个f 函数，在氢原子上加的三个p 函数和一个d 函数。这样的基组在电子相关方法对于描述电子之间的作用有很重要意义。 第4周期以后的原子的基组 第4周期以上的原子的基组很难处理。由于存在非常大的核，原子核附近的电子通过有效核电势方法(ECP)进行了近似，这一处理同时也包含了相对论效应。这其中，LANL2DZ 是最有名的基组。 基组的选择 G03输入概述 单点能计算(single point) 单