一种计算水溶解度的经验加合模型的适用范围与局限-物理化学学报.PDF

物理化学学报(Wuli Huaxue Xuebao) October Acta Phys. -Chim. Sin . 2012, 28 (10), 2249-2257 2249 [Article] doi: 10.3866/PKU.WHXB201209171 一种计算水溶解度的经验加合模型的适用范围与局限 段宝根 李 嫣 李 婕 程铁军 王任小* ( 中国科学院上海有机化学研究所, 生命有机化学国家重点实验室, 上海200032) 摘要: 我们发展了一种用于预测有机小分子化合物水溶解度(logS)的经验方法XLOGS. 它本质上是一种加合 模型, 采用83 种原子/基团类型和3 个校正因子作为模型的描述符. 该方法还可以根据一个合适的参照分子的 logS 实验值来计算未知化合物的logS 值. 我们将XLOGS 模型在由4171 个化合物组成的训练集上进行了参数 2 化, 多元线性回归获得的相关系数(R )和标准偏差(SD)分别为0.82 和0.96 单位. 将该训练集进一步分为仅含液 体化合物和仅含固体化合物的两个子集. XLOGS 模型在这两个子集上的回归结果显示前者优于后者(标准偏 差分别为0.65 单位和0.94 单位). 还利用log1/S 和logP(脂水分配系数)之间的差值来研究XLOGS 方法在液体 和固体化合物数据集上的表现. 研究结果表明: XLOGS 等加合法模型更适合应用于这两者差值接近于0 的化 合物. 还将XLOGS 和其它三种流行的logS 计算模型(包括Qikprop, MOE-logS 和ALOGPS)在一个含有132个 类药化合物的独立测试集上进行了比较. 总体而言, 我们的研究结果为加合法模型在水溶解度预测方面的合理 应用提供了指导. 关键词: 水溶解度; 加合法模型; XLOGS 中图分类号: O645 An Empirical Additive Model for Aqueous Solubility Computation: Success and Limitations DUAN Bao-Gen LI Yan LI Jie CHENG Tie-Jun WANG Ren-Xiao* (State Key Laboratory of Bioorganic Chemistry, Shanghai Institute of Organic Chemistry, Chinese Academy of Sciences, Shanghai 200032, P. R. China) Abstract: We have developed a new empirical model, namely XLOGS, for computing aqueous solubility (logS) of organic compounds. This model is essentially an additive model, which employs a total of 83 atom/ group types and three correction factors as descriptors. Furthermore, it computes the logS value of a query