第十二章 印迹杂交技术.pdfVIP

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第十二章 印迹杂交技术 Molecular hybridization 印迹技术(blot) ——指将电泳分离的样品(核酸或蛋 白质)从凝胶转移到印迹膜上,然后 与标记探针进行杂交来检测样品的方 法。 • 印迹法分类: Southern Blot DNA印迹 Northern Blot RNA印迹 Western Blot 蛋白质印迹(免疫印迹) Eastern Blot Western Blot的一种变形 第一节 核酸杂交的 基本概念 温度、酸碱、有 机溶剂、尿素等  核酸变性:在某些理化因素作用下,核 酸分子互补双链之间氢键断裂,使双螺 旋结构松散变成单链的过程。  DNA变性:在变性因素作用下,DNA分 子互补双链之间氢键断裂,使双螺旋结 构解开成两条单链的过程。  DNA复性(renaturation):在适当条 件下,变性DNA的两条互补链可恢复天 然的双螺旋构象。  退火(annealing):热变性的DNA经缓 慢冷却后即可复性。 DNA 变性的本质是双链间氢键的断裂 变性引起紫外吸收值的改变 DNA 的紫外吸收光谱 • 增色效应:核酸在变性过程中260nm 波长吸收值(A260 )增加 • 减色效应:核酸在复性过程中260nm 波长吸收值(A260 )减小 DNA加热 50%DNA 发生变性 此时的温度——解链温度 (melting temperature, Tm) G—C百分含量与Tm的关系 核酸分子杂交 单链的核酸分子在合适条件下,与具有碱 基互补序列的异源核酸形成杂化双链的过 程。 • 核酸分子杂交可在DNA与DNA、DNA与RNA、RNA 与RNA的两条单链间进行。 核酸分子杂交的体系 液相杂交:待测核酸和探针均游离于溶液。 固相杂交(常用):将待测核酸(或探针)固 定于固相支持物,然后与溶液中的游离探针(或 待测核酸)进行杂交,形成的杂交体结合于固相 支持物上。 第二节 核酸探针与 标记 探针(probe) ——能与待测的分子发生特异性相互作用, 并可被特殊的方法探知的分子(带有标记 物)。 • 探针的检测对象:核酸、蛋白质、细胞结构等。 • 除核酸探针外,探针利用抗体-抗原、配体-受 体等相互作用的原理与靶分子结合。 一、核酸探针 ——带有标记物且序列已知的核酸片段, 能与待测核酸中的特定序列特异杂交。 • 核酸探针是否合适是决定核酸杂交分析 能否成功的关键。 核酸杂交与分子探针 核酸探针应具有的条件 ① 特异性高:只与待测核酸样品中的 互补序列杂交。 ② 带有标记物:标记物灵敏度高而稳 定,检测方便。 核酸探针的种类  基因组DNA探针  cDNA探针  RNA探针  寡核苷酸探针 基因组DNA探针 • 直接从基因组文库中筛选后、酶切制备; 或用PCR扩增基因组中的目的基因制备。 • 包含目的基因的全部序列或部分序列, 是最常用的DNA探针。 • 优点:制备简便;不易降解;标记方法 成熟。 • 注意:尽可能用基因的编码顺序(外 显子)作为探针。 cDNA探针 优点:mRNA逆转录而来,不含内含子等 非编码区,特异性高;适用于研究基因表达。 缺点:获取过程复杂,不易制备 RNA探针 ① 是单链探针,所以

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