单核苷酸多态性检测方法研究概述及其应用.pdfVIP

玉 米科学2009 ，17(3)：142～145 Journal of Maize Sciences 文章编号：1005- 0906(2009)03- 0142- 04 单核苷酸多态性检测方法研究概述及其应用 1 1 2 1 李 琳 ，杨德光 ，胡 正 ，王永力 (1.东北农业大学农学院，哈尔滨 150030；2. 中国农业科学院作物科学研究所，北京 100081) 摘 要：单核苷酸多态性(SNP)作为第3 代分子标记有着广阔的应用前景。本文从单核苷酸多态性(SNP)的概 念、分类、特点、检测技术等方面进行了概述，论述了单核苷酸多态性在高密度遗传图谱构建、性状作图、病害关联性 分析、标记辅助育种等方面的应用，为单核苷酸多态性的研究提供理论依据。 关键词：单核苷酸多态性；作物；检测技术 中图分类号：Q503 文献标识码：A The Outline of Detection for Single Nucleotide Polymorphism 1 1 2 1 LI Lin , YANG De- guang , HU Zheng , WANG Yong- li (1. Agronomic College of Northeast Agricultural University, Harbin 150030; 2. Institute of Crop Science, Chinese Academy of Agricultural Sciences Beijing 100081, China) Abstract ：As the third molecular marker technology, single nucleotide polymorphism(SNP) has been used in many areas and owning the bright future. This thesis introduced the definition, classification, character, the method of detection and the using in crop of, SNP, discussed the application of SNP on construction of high- density genetic map, trait mapping, analysis of disease association and marker- assisted breeding, gave the theory basis for the studies in field of SNP. Key word：SNP; Crop; Detection technology 单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism, 体表现型是无意义的，但对群体而言，这些SNP 作 SNP)是指染色体基因组水平上单个核苷酸变异引起 为遗传标记在群体遗传和生物进化中却有很大作 的DNA 序列多态性，其最少一种等位基因在群体中 用。cSNP 对生物遗传性状影响可分为两类：一是同 的频率不少于1%，美国界定此频率为2% 。它是继 义cSNP(Synonymous cSNP)，即SNP 所致的编码序列 限制性片断长度多态性(Restriction Fragment Length 的改变并不影响其所翻译的蛋白质；二是非同义 Polymorphism, RFLP)、简单重复序列(Simple Sequence cSNP(Non- synonymous cSNP)，即SNP 所致的编码序 Repeat, SSR