青海上北山林场野生桃儿七根部内生真菌群落组成及多样性研究.PDFVIP

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20 16 4 4 1 7 Vol. 4 1,No. 7 April ,20 16 年 月 第 卷第 期 青海上北山林场野生桃儿七根部内生真菌群落 组成及多样性研究 1,2 1,4 1,3 1,3 1,3 * , , , , 宁祎 李艳玲 周国英 杨路存 徐文华 (1. , 81000 1 ;2. , 100049 ; 中国科学院西北高原生物研究所 青海西宁 中国科学院大学 北京 3. , 81000 1 ; 中国科学院藏药研究重点实验室 青海西宁 4. , 100085) 中国科学院生态环境研究中心 北京 [ ] (NGS), ITS 1 , 摘要 该研究通过应用第二代测序技术 即高通量测序方法测序青海野生桃儿七根内真菌宏基因组 区 并依 RDP , 。 , 据 中设置的分类阈值对处理后的序列进行物种分类 鉴定内生真菌的群落组成 研究结果显示 测序结果经过质量控制 22 565 , 97% , (OTUs) 517 , 共获得有效条带 条 依据 的序列相似性做聚类相似性分析 获得全部样品的可分类操作单元 共 个 RDP 0. 8 13 、35 、44 、55 。3 LD1,LD2 ,LD3 分类依据 的分类阈值鉴定出的全部真菌可归类为 纲 目 科 属 个样品 中共同的优势 Tetracladium ( 35. 49% ,68. 55% ,12. 96% ), 属真菌为 属 所占比例分别为 样品的香浓多样性指数和辛普森多样性指数分别在 1. 75 ~ 2. 92 ,0. 11 ~ 0. 32 。 , , 研究结果表明 青海上北山林场野生桃儿七根内内生真菌具有较高的多样性和较复杂的群落组成 ,

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