青海东方蜜蜂贵德种群的遗传分化地位-中国科学院西北高原生物研究.PDFVIP

2016 年5 月第67 卷 中国蜂业 APICULTURE OF CHINA 试验研究报告 19 青海东方蜜蜂贵德种群的遗传分化地位 芳1, 2 2, 3 1, 2 1 立1 1, 2 赵 陈振华 李文靖 张同作 皮 林恭华 （1 中国科学院西北高原生物研究所，西宁810001；2 青海中科蜜蜂研究院，西宁 810001； 3 青海青藏华峰中蜂蜂业有限公司，贵德811700） 摘 要：对青海东方蜜蜂贵德种群（QHGD）进行全基因组测序，并结合现有其他地区东方蜜蜂的分子序列信 息，分析QHGD 种群的遗传分化地位。测序、组装和比对后得到Cytb、tRNAIle~ND2 、16S rRNA、EF1-α、COI~COII 序 列对应的比对文件。单倍型分析显示，QHGD 种群的Cytb、EF1-α、COI~COII 序列与国内其他种群有重叠，但tR－ NAIle~ND2、16S rRNA 序列则形成特有的单倍型。基于tRNAIle~ND2 、16S rRNA、EF1-α 合并序列的Network 分析 显示，QHGD 种群与四川九寨（SCJZ）、四川马尔康（SCMEK）等地方种群成辐射状与一个median vector 节点（mv1） 连接。本研究的结果表明，青海贵德种群是较为独特的一个进化分支单元，需要在未来的保护和开发利用过程中予 以关注。 关键词：东方蜜蜂；贵德种群；遗传分化；基因组 Genetic variation status of Apis cerana population from Guide, Qinghai Zhao Fang1, 2 Chen Zhenhua2, 3 Li Wenjing1, 2 Zhang Tongzuo1 Pi Li1 Lin Gonghua1, 2 （1 Northwest Institute of Plateau Biology, Chinese Academy of Sciences, Xining 810001;2 Qinghai-CAS Institute of Apicultural Research, Xining 810001; 3 Qinghai Qingzang -Huafeng Eastern Honeybee Industry Co.,Ltd, Guide 811700） Abstract:We sequenced the wholegenome of Apis cerana from Guide population (QHGD) and, combining with se－ quence data on A.cerana populations from other regions, we analyzed the genetic variation status of the QHGD popula－ tion. After sequencing, assembling, and aligning, we obtained alignments for five DNA fragments including Cytb, tR－ NAIle~ND2, 16S rRNA, EF1-α, and COI~COII. Haplotype analysis showed that the QHGD population shared haplo－ types with other populations on Cytb, EF1-α and COI~COII, in contrast, the QHGD population formed a unique haplo－ type on tRNAIle~ND2 and 16S rRNA, respectively. Network analysis based on a combination of tRNAIle~ND2, 16S r