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江苏农业科学 2019年第47卷第2期 — 73—
加依娜·吾永巴衣,胡文明,阿迪里·托乎尼亚孜,等.基于质量和数量性状混合的高粱遗传多样性分析[J].江苏农业科学,2019,47(2):73-76.
doi:10.15889/j.issn.1002-1302.2019.02.016
基于质量和数量性状混合的高粱遗传多样性分析
加依娜 ·吾永巴衣,胡文明,阿迪里 ·托乎尼亚孜,徐翠莲
(塔里木大学植物科学学院,新疆阿拉尔843300)
摘要:为了解高粱种质资源的遗传多样性,以56份来自不同国家和地区的高粱种质为研究对象,分别对其叶脉
色、穗型、穗形、芽鞘色、颖壳色、粒色、颖壳包被度7个质量性状和生育期、株高、穗长、穗粒质量、千粒质量5个数量性
状进行鉴定,分析各性状的多样性指数,并利用质量性状和数量性状进行混合数据系统聚类。结果表明,2类性状均
具有广泛的遗传变异,数量性状遗传多样性指数高于质量性状,其多样性指数的变异范围为1.639~2.012,而质量性
状的多样性指数变异范围为0.879~1.498。系统聚类结果表明,在估计节点AU=95时,所有种质聚为28类,其中38
份种质聚为10类,平均每类包含3.8份种质,其余18份种质分别单独归类;在AU=90时,所有种质聚为2类,分别包
含13、43份种质。说明收集的56份种质具有丰富的遗传多样性,是进行性状改良和遗传研究理想的原始材料。
关键词:高粱;质量性状;数量性状;遗传多样性;估计节点;系统聚类
中图分类号:S514.032 文献标志码:A 文章编号:1002-1302(2019)02-0073-04
一般来说,作物的表型性状主要有质量和数量性状2种 聚类”的方法利用“自举再抽样”能够无偏估计材料间聚为一
类型,前者受单基因或寡基因控制,其表达不易受环境的影 类的概率,是一种有效的聚类方法[19-20]。本研究以前期收集
响,作物的穗型、籽粒的颜色等属于质量性状;后者主要受微 到的56份高粱种质为研究对象,基于质量性状和数量性状混
效多基因控制,其表达极易受环境的影响,作物的株高、穗长、 合的农艺性状,利用 Shannon-Weaver遗传多样性指数对其
粒质量、生物量等相关性状属于数量性状。作物质量性状和 进行多样性分析,采用R软件进行“P值聚类”和“自助再抽
数量性状的改良均离不开优异种质资源的收集和利用。育种 样”估计节点的近似无偏概率(approximateunbiased,AU)、自
家在进行作物性状改良时,为了解种质资源的遗传背景及亲 动再抽样概率(bootstrapprobability,BP)概率,采用欧式距离
缘关系,须要考察种质资源的各类性状,分析其遗传多样性和 (euclideandistance)和Ward法进行聚类,以期为今后开展有
材料间遗传差异的大小;同样,遗传研究者为提高基因挖掘的 益等位基因的发掘和品种选育提供有价值的参考。
效率在发掘重要性状 QTLs基因时,也要求群体的性状具有
1 材料与方法
较大的遗传变异。遗传差异的大小可利用品种或群体的表型
数据和分子标记数据[1-3]进行多样性和聚类分析加以衡 1.1 供试材料
量[4-6],由于利用表型数据进行多样性分析具有简单、便捷等 56份国内外高粱种质均由国家种质资源库提供,其中有
[7-9] [10] [11] [12] [13]
优点而在小麦 、玉米 、绿豆 、薏苡 、大豆 、小 9份种质来自中国,代号分别为X1~X8、X12,其余47份种质
[14] [15] [16]
豆 、旱稻 、甜高粱 等作物上得以广泛应用。前人的研 原产于美国、印度、日本、墨西哥、埃塞俄比亚、捷克和马里共
究大多利用数量性状进行分析,而对于聚类分析中,分类数目 7个国家(表1)。
的确定
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