一种基于液相色谱-质谱技术进行血清代谢组学研究-中国科学杂志社.PDF

一一种种基基于于液液相相色色谱谱-质质谱谱技技术术进进行行血血清清代代谢谢组组学学研研究究的的方方法法: 从从代代谢谢指指纹纹到到潜潜在在标标 物物 陈静, 单圆鸿, 严沁, 赵素敏, 尹沛源, 赵欣捷, 路鑫, 席晓薇, 万小平 and 许国旺 Citation: 中国科学B辑: 化学 39, 1268 (2009); doi: 10.1360/zb2009-39-10-1268 View online: htt :///doi/10.1360/zb2009-39-10-1268 View Table of Contents: htt :/// ublisher/sc /journal/SSPC-B2/39/10 Published by the 《中国科学》杂 社 Articles you may be interested in Mass s ectrometry-based metabolomics and their develo ments in China SCIENTIA SINICA Chimica 44, 724 (2014); 基于代谢组学技术的辛伐他汀对磷脂类物质作用的初探 Science in China Series B-Chemistry (in Chinese) 39, 793 (2009); 气虚血瘀证大鼠尿液的核磁共振谱代谢组学 Chinese Science Bulletin 52, 1758 (2007); 多维液相色谱技术的进展 Science in China Series B-Chemistry (in Chinese) 39, 670 (2009); 采用反相液相色谱作用指数进行已知保留值定性的研究 Science in China Series B-Chemistry , Life Sciences Earth Sciences (in Chinese) 22, 135 (1992); 中国科学 B 辑 :化学 2009 年 第 39 卷 第 10 期 : 1268 ~ 1276 SCIENCE IN CHINA PRESS 一种基于液相色谱-质谱技术进行血清代谢组学 研究的方法: 从代谢指纹到潜在标志物 ① ① ② ① ① ① ① ② 陈静 单圆鸿 严沁 赵素敏 尹沛源 赵欣捷 路鑫 席晓薇 万小平② 许国旺①* ① 中国科学院大连化学物理研究所, 中国科学院分离分析重点实验室, 大连 116023 ② 上海交通大学附属第一人民医院妇产科, 上海 200080 * 通讯作者, E-mail: mailto:xugw@ 收稿日期: 2009-07-14; 接受日期: 2009-08-20 摘要 本文描述了一种基于液相色谱-质谱技术(LC-MS) 的代谢组学发现疾病潜在标志物的 关键词 方法. 该方法利用LC-MS 获得代谢指纹图谱, 并通过多种统计分析方法对产生的海量数据进 代谢组学 行分析, 最终筛选出潜在标志物. 数据分析过程包括: 通过归一化、修正80%规则、数据集分 液质联用 割和数据缩放等方法对数据集进行预处理; 通过正交校正的偏最小二乘(OPLS)模式识别方法 宫颈癌 肿瘤标志物 对样品进行分型; 根据模型的变量重要性因子( VIP值) 、非参数检验结果和z 值筛选潜在标志物. 以宫颈癌血清样本为例, 应用上述方法, 15 个变量被确认为潜在标志物, 操作者接受曲线 (ROC)下的面积为0.667~0.956. 经过相关性分析和结构鉴定, 发现这15个变量来自9 个化合物. : : : : 其中7 个化合物被鉴定为色氨酸、硬脂酸、花生四烯酸、溶血磷脂酰胆碱(0 0/16 0, 16 0/0 0, : :