基于SAMPL的一种微卫星筛选方法在中国明对虾中的尝试-海洋科学.PDFVIP

基于 SA M PL 的一种微卫星筛选方法在中国明对虾中的尝试 1 ,2 ,3 2 2 4 1 张留所 ,孔晓瑜 ,喻子牛 ,孔 　杰 ,相建海 ( 1. 中国科学院 海洋研究所 , 实验海洋生物学重点实验室 , 山东 青岛 26607 1 ;2 . 中国海洋大学 教育部海水 养殖重点实验室 , 山东 青岛 266003 ;3 . 中国科学院 研究生院 , 北京 100039 ;4 . 中国水产科学研究院 黄海水 产研究所 , 山东 青岛 26607 1) ( 摘要 :微卫星的发展主要受限于微卫星及其旁侧特异引物区的分离 ,在中国明对虾 Fenne r ) ( op enaeus chi nens is 中建立了选择性扩增多态微卫星位点 SA M PL , selective amp lified mic ro sat ellit e polymorp hic loci) 技术体系 ,并初步尝试了基于 SA M PL 的一种微卫星筛选方法 。 通过 5′端锚定引物引入微卫星序列 ,对传统 SA M PL 技术加以改进并以期富集简单重复序 ( ) 列 。从测序胶上随机选择 5 条 SA M PL 条带 分别命名为 S11 ,S13 ,S14 ,S22 , S24 克隆测序 , 大小分别为 16 1 , 157 , 147 , 152 , 298 。其 中 S11 , S13 , S14 , S22 四个片段两端 引物分别为 A FL P 选择性引物和 SA M PL 引物 ,S13 和 S22 含微卫星序列重复 ,S24 两端引物均为传统的 ( ) A FL P 引物 , 在此片断中有一 A G 39 重复 。 ( ) ( ) 关键词 :选择性扩增多态微卫星位点 SA M PL ; 中国明对虾 Fenne rop enaeus chi nens is ;微 卫星 中图分类号 :Q3 1 　　　文献标识码 :A 　　　文章编号 (2006) 02000 104 ( ) [ 10 ] 　　微卫星 micro sat ellit e , M S 又称简单序列重复 A FL P 技术的延伸 ,在不需克隆、设计特异引物情 ( simple sequence rep eat , SSR) , 是 1～6 个核苷酸重 况下 ,可用来扩增微卫星序列 , SA M PL 技术作为结 复序列 。作为具有共显性 、数量丰富、广泛分布于基 合了 A FL P 和微卫星两者优点的分子标记已应用于 因组并符合孟德尔遗传等特点的高信息度分子标 植物遗传多样性分析 、连锁图谱构建等领域[