医学生物学人类基因组计划与功能基因组学.ppt

三、功能基因组学 人类基因组计划 与功能基因组学 HGP研究的是遗传图、物理图、序列图、基因图，主要探讨人类基因组的结构特点，又称结构基因组学(structural genomics)。 在HGP进行的同时，也开始研究人类基因组计划相关及以后的领域，即所谓的后基因组计划(past-genome project)。后基因组计划以解释基因组的功能和调控机制为研究目标，所以又称功能基因组学(functional genomics)。 人类基因组计划与基因组学 1．人类基因组多样性计划 人类基因组多样性计划(human genome diversity project，HGDP)旨在采集与保存世界范围内一些地理隔离的部落群体和具有独特文化或语言背景的群体的基因组DNA，其目标是要揭示世界上不同民族生理生化差异的遗传背景，以及群体之间的相互关系。 人类基因组计划与基因组学 1．人类基因组多样性计划 人类是一个具有多态性的群体。要真正了解全人类的基因组特征，就应开展人类基因组多样性的系统研究，比较不同人种、民族、族群之间基因组的差异，建立各个群体的遗传资料信息库，并与考古学、人类学、语言学等研究成果相结合，为探讨人类的起源、进化和迁移的历史提供重要的证据。 人类基因组计划与基因组学 2．比较基因组学 比较基因组学(comparative genomics)是基于基因组图谱和测序基础上，在DNA水平上对不同生物基因组的结构进行比较，以研究基因的结构功能、表达机制和物种进化的学科。 人类基因组计划与基因组学 2．比较基因组学 人类基因组计划与基因组学 主要的模式生物 大肠埃希菌(E. coli) 酵母菌(S. cerevisiae) 秀丽线虫(C. elegans) 果蝇(D. melanogaster) 小鼠(M. musculus) 2．比较基因组学 人类基因组计划与基因组学 各种生物基因组序列的比较 生物种类 基因组大小 预测基因组数目 平均基因长度 大肠埃希菌 4632221bp 1800 约1kb 酵母 12Mb 5800 约2kb 秀丽线虫 97Mb 18500 约5.3kb 果蝇 116Mb 13600 约10kb 小鼠 3000Mb 40000 约30kb 2．比较基因组学 模式生物体的基因组的结构相对简单，但是它们的核心细胞过程和生化通路在很大程度上是保守的。 对模式生物的研究有助于发展和检验新的相关技术，能够了解基因组的进化、从而加速对人类基因组结构和功能的了解，还可为阐明基因表达机制提供了重要的线索。 人类基因组计划与基因组学 2．比较基因组学 根据保守性核心序列建立的数据库，不仅可探索基因组进化的连续性、变异性，以及不同生物之间亲缘关系的远近，对人类基因的鉴定和分离也具有重要的价值。 人类基因组计划与基因组学 3．环境基因组学 环境基因组学(environmental genomics) 的目的是研究环境对人类疾病的影响和意义。 人类基因组计划与基因组学 分析、鉴定与环境相关的疾病易感基因，识别基因组多样性和结构功能的关系 预测环境因素影响人类健康的风险并制定相应预防措施和环境保护策略 4．疾病基因组学 疾病基因组学的主要任务是鉴定和分离重要疾病的致病基因与相关基因，并确定其致病机制。 人类基因组计划与基因组学 单基因病：定位克隆 候选克隆 多基因病：全基因组关联研究 隔离群体的QTL 5．药物基因组学 药物基因组学(pharmacogenomics)是研究机体对包括药物在内的化学物质反应的遗传差异，以寻找更为有效的药物作用。 人类基因组计划与基因组学 “个体化”药物的研制 “个人健康计划”的制订 6．蛋白质组学 蛋白质组的概念是1994年由澳大利亚学者M. Wilkins首次提出来的，“proteome”一词源于“PROTEin”与“genOME”的组合，是指细胞基因组所表达的执行生命活动的全部蛋白质的存在及活动方式。 人类基因组计划与基因组学 6．蛋白质组学 蛋白质组是一个动态概念，同一机体的不同组织和不同细胞在不同发育阶段、不同生理状态及在不同外界条件下的蛋白质组都是不同的。 蛋白质组学研究的主要内容是要从整体水平上研究蛋白质的水平和修饰状态，并建立蛋白质相互关系的目录。 人类基因组计划与基因组学 6．蛋白质组学 人类基因组计划与基因组学 2001，国际人类蛋白质组组织(HUPO)成立 美国牵头：人类血浆蛋白质组计划(HPPP) 中国牵头：人类肝脏蛋白质组计划(HLPP) 现代生物学与现代医学 第十二章 人类基因组计划与功能基因组学 人类基因组计划(human genome project，HGP)是一项国际性科学研究计划，旨在阐明人类基因组30亿个碱基