利用甘蓝型油菜高密度SNP遗传图谱定位油酸亚麻-中国农业科学.PDFVIP

中国农业科学 2014,47(1):24-32 Scientia Agricultura Sinica doi: 10.3864/j.issn.0578-1752.2014.01.003 利用甘蓝型油菜高密度SNP遗传图谱定位油酸、 亚麻酸及芥酸含量QTL位点 刘列钊，李加纳 （西南大学农学与生物科技学院，重庆 400715 ） 摘要：【目的】菜籽油包括多种脂肪酸组分，提高油酸（C18:1）含量，降低亚麻酸（C18:2）和芥酸（C22:1） 含量是油菜育种改良和遗传研究的重要目标。本研究利用刚开发的油菜 60K 芯片构建的高世代重组自交系群体 遗传连锁图谱，对 3 个不同环境中影响甘蓝型油菜品质的油酸、亚麻酸及芥酸含量进行 QTL 定位分析，研究结 果可对脂肪酸组分 QTL 位点在不同的群体之间准确比较分析。【方法】以高芥酸亲本 GH06 为母本和低芥酸亲本 P174 为父本构建高世代重组自交系，分别于 2008 年在德国吉森、德国霍亨里特及 2009 年德国吉森 3 个不同的 环境中设置田间试验，收获自交种子，采用近红外分析方法 3 次重复对种子的脂肪酸组分进行分析。利用油菜 60K 芯片对重组自交系群体进行基因型分析，DNA 样品预处理及芯片处理严格按照 Illumina Inc 公司 Infinium HD Assay Ultra 操作说明进行。取最小阈值 LOD 5.0 利用 MSTmap 软件构建遗传图谱。QTL 定位所用的遗传图谱 包括 2 756 个 SNP 位点，覆盖甘蓝型油菜基因组 1 832.4 cM。利用 Windows QTL Cartographer 复合 区间作图 法对油酸、亚麻酸及芥酸含量进行 QTL 定位。【结果】在 3 个环境中，油酸和芥酸含量均表现为极显著负相关， 相关系数均达到-0.95，且表现为主基因控制的性状，芥酸和亚麻酸表现负相关，油酸与亚麻酸表现正相关。3 个性状在 3 个环境中共检测到 14 个 QTL，在 A08 和 C03 上都检测到油酸和芥酸含量重叠的主效 QTL 位点。在 3 个环境中，油酸主效 QTL 位点解释表型变异 19%—31%，芥酸主效 QTL 位点解释表型变异 19%—34%，两者表现 加性效应相反。A08 和 C03 染色体上的芥酸主效 QTL 位点加性效应在 3 个环境中为 7.6 到 9.6，加性效应来自 低油酸、高芥酸亲本 GH06。亚麻酸属于典型的数量性状，受环境影响较大，在 3 个环境中检测到不同的微效 QTL 位点，解释表型变异 3%—12%。遗传图谱与物理图谱比较分析发现，脂肪酸去饱和酶 FAD2 基因位于亚麻酸 QTL qA05C18:3 的置信区间，而脂肪酸延长酶 FAE1 基因位于芥酸 QTL qA08C22:1 的置信区间。【结论】利用该 套油菜 60K 芯片准确定位了油酸、亚麻酸及芥酸 QTL 位点，位于 A08 和 C03 染色体上的芥酸主效 QTL 位点同时 也是油酸的主效 QTL 位点，该研究结果有利于不同群体在使用该套 SNP 芯片分析及对脂肪酸组分定位后准确比 较分析。 关键词：甘蓝型油菜；单核苷酸多态性；脂肪酸；QTL QTL Mapping of Oleic Acid, Linolenic Acid and Erucic Acid Content in Brassica napus by Using the High Density SNP Genetic Map LIU Lie-zhao, LI Jia-na (College of Agronomy and Biotechnology, Southwest University, Chongqing 400715) Abstract: 【Objective 】Rapeseed oil contains many fatty acid components and the major go