烤烟去甲基萘醌甲基转移酶类似基因cDNA克隆与生物信息学分析.PDF

广东农业科学 年第 期 162 2011 5 烤烟去甲基萘醌甲基转移酶类似基因 cDNA 克隆与生物信息学分析 胡重怡， 蔡刘体 （贵州烟草科学研究所，贵州贵阳 550081 ） 摘 要： 去甲基萘醌甲基转移酶是甲基萘醌代谢途径中的最后一步关键酶， 能将二甲基萘醌转化为甲基萘醌， 还可以调节 的代谢。 从烤烟品种南江 号（ ）均一化 文库中克隆获得 个去甲基萘醌甲基转移酶 RNA 3 Nicotiana tobacum cv. Nanjiang-3 cDNA 1 类似基因cDNA 全长序列，命名为T-DM1 ，GenBank 中的登录号为HO663886 ，该基因全长741 bp 。利用ORF finder 和ProtParam 软 件分析表明，它包含一个长度为501 bp 的完整开放读码框，编码一个含有 166 个氨基酸、等电点为5.70 、分子量为 17.77 kV 的蛋 白。 Blast 搜索结果及进化分析结果表明，烤烟T-DM1 基因编码的蛋白与棉花、玉米和拟南芥的去甲基萘醌甲基转移酶基因具有 较高的同源性，其一致性分别为96% 、86%和85% 。 关键词：烤烟； 去甲基萘醌甲基转移酶； 克隆； 生物信息学分析 中图分类号： 文献标识码： 文章编号： （ ） S572 A 1004-847X 2011 05-0162-03 Cloning and bioinformatics analysis of T-DM1 cDNA from flue-cured tobacco HU Zhong-Yi, CAI Liu-ti (Guizhou Tobacco Research Institute,Guiyang 550018,China) Abstract: Demethylmenaquinone methyltransferase, the final step of menaquinone biosynthesis ,whick convert dimethylmenaquinone (DMK) to menaquinone (MK),furthermore,it also regulates RNA metabolism, which inhibits the endonuclease activity and thereby leads to increase the half-life and abundance of RNAs.From the Normalized DNA library of the flue-cured tobacco cultivar Nanjiang-3, the full length cDNA sequenc