三黄鸡MAVS基因克隆及生物信息学分析.pdfVIP

三黄鸡MAVS基因克隆及生物信息学分析.pdf

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of 南方农业学报JournalSouthern Agriculture2016。47(7):1216-1221 ISSN2095—1 191;CODENNNXAAB http:Ilwww.曲lyxb.Ⅲn DOI:10.3969/j:issn.2095—1191.2016.07.1216 三黄鸡MA垤基因克隆及生物信息学分析 曹艳杰,何怡宁,王海勇,唐 宁,张丽华,韦 平,韦天超,磨美兰+ (广西大学动物科学技术学院,南宁530005) 摘要:【目的】掌握三黄鸡线粒体抗病毒信号蛋白(MAvs)基因的生物信息学,为MAvs基因诱导表达及禽类固 有免疫相关机制研究打下基础。【方法】根据GenBank中已公布的原鸡MAVS基因序列设计l对特异性引物,采用 RT-PCR扩增三黄鸡MAVS基因,并应用相关生物软件进行序列分析及其蛋白结构预测。【结果】三黄鸡MAVS基因编 码区(CDS)全长1926 001012911.1)比对, bp,编码641个氨基酸,与GenBank中已发表的原鸡MAVS氨基酸序列(NP 黄鸡MAV:S基因与原鸡的相似性最高,达99.O%;与日本鹌鹑的相似性次之,为91.0%;与斑马鱼的相似性最低,仅 37.6%。三黄鸡MAVS蛋白分子质量为67.79 ku,理论等电点(pI)为5.04,属于跨膜蛋白,无信号肽序列;其二级结构中 折叠占0.5%,无规则卷曲占88.7%,螺旋占10.8%。【结论】三黄鸡MAys基因序列表现出高度的保守性,可作为今后研 究三黄鸡抗病毒机制的重要指标之一。 关键词:三黄鸡;MAVL5基因;克隆;生物信息学;相似性 中图分类号:$831.89 文献标志码:A and ofMA bioinformatics VS Cloning analysis gene from chicken Sanhuang CAO Li-hua, Yan-jie,HEYi-ning,WANGHai-yong,TANGNing,ZHANG WEI Mei-lan+ Tian—chao,MO Ping,WEI dAnimalScienceand 530005,China) (College Technology,GuangxiUniversity,Nanning was of conductedto bioinformaticscharacteristicchicken Abstract:【ObjeetivelThepresentexperiment analyze Sanhuang mitochondrialanti—viral orderto foundationforresearchoninduced sign

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