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南方农业学报JournalSouthern
Agriculture2016。47(7):1216-1221
ISSN2095—1
191;CODENNNXAAB http:Ilwww.曲lyxb.Ⅲn
DOI:10.3969/j:issn.2095—1191.2016.07.1216
三黄鸡MA垤基因克隆及生物信息学分析
曹艳杰,何怡宁,王海勇,唐 宁,张丽华,韦 平,韦天超,磨美兰+
(广西大学动物科学技术学院,南宁530005)
摘要:【目的】掌握三黄鸡线粒体抗病毒信号蛋白(MAvs)基因的生物信息学,为MAvs基因诱导表达及禽类固
有免疫相关机制研究打下基础。【方法】根据GenBank中已公布的原鸡MAVS基因序列设计l对特异性引物,采用
RT-PCR扩增三黄鸡MAVS基因,并应用相关生物软件进行序列分析及其蛋白结构预测。【结果】三黄鸡MAVS基因编
码区(CDS)全长1926 001012911.1)比对,
bp,编码641个氨基酸,与GenBank中已发表的原鸡MAVS氨基酸序列(NP
黄鸡MAV:S基因与原鸡的相似性最高,达99.O%;与日本鹌鹑的相似性次之,为91.0%;与斑马鱼的相似性最低,仅
37.6%。三黄鸡MAVS蛋白分子质量为67.79
ku,理论等电点(pI)为5.04,属于跨膜蛋白,无信号肽序列;其二级结构中
折叠占0.5%,无规则卷曲占88.7%,螺旋占10.8%。【结论】三黄鸡MAys基因序列表现出高度的保守性,可作为今后研
究三黄鸡抗病毒机制的重要指标之一。
关键词:三黄鸡;MAVL5基因;克隆;生物信息学;相似性
中图分类号:$831.89 文献标志码:A
and ofMA
bioinformatics VS
Cloning analysis gene
from chicken
Sanhuang
CAO Li-hua,
Yan-jie,HEYi-ning,WANGHai-yong,TANGNing,ZHANG
WEI Mei-lan+
Tian—chao,MO
Ping,WEI
dAnimalScienceand 530005,China)
(College Technology,GuangxiUniversity,Nanning
was of
conductedto bioinformaticscharacteristicchicken
Abstract:【ObjeetivelThepresentexperiment analyze Sanhuang
mitochondrialanti—viral orderto foundationforresearchoninduced
sign
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