使用ProteOnXPR36系统进行蛋白和小分子化合物之间相互作用的分析.PDF

使用ProteOn XPR36 系统进行蛋白 和小分子化合物之间相互作用的分析 很多小分子化合物具有特殊的活性基团，可以结合某些特定的蛋白或核酸，激发或者抑制生物大分 子的活性，从而影响生命的过程。人体内种类繁多的维生素类、辅酶等物质就是这些活性小分子化合物。 在药物方面，有很多药都是一些有着特殊活性的小分子化合物，分子量从200 Dalton 到数千Dalton。 因此，小分子药物筛选、优化和药物机理研究成为了制药和药理学研究的重点。目前关于这方面研究的 手段，从不同的目的出发有不同的方法。但如果要测定某些化合物和靶蛋白之间的相互作用动力学和亲 和力，最好的办法非SPR 技术莫属。 ProteOn XPR36 蛋白相互作用阵列系统是 记在芯片上，可达21,200 RU 。待基线稳定后再上 Bio-Rad公司 2007 年隆重推出的新一代SPR生物 小分子抑制剂溶液。待反应全部结束后，用 传感器。它具有 6×6 的芯片格式，可以在芯片上 ProteOn Manager 软件分析结果。这些小分子抑 同时或分次固定6 种蛋白（ligand），然后化合物 制剂的名称、分子量、反应最高浓度和结果等信息 （analyte ）以 6 种不同的浓度平行地流过所有 见下表，反应曲线见下图： ligand，36 对相互作用的反应曲线同时记录，同时 分析。只需一次进样就可以分析一种药物和多种不 同靶蛋白之间相互作用的动力学和亲和力常数。这 种分析方法不仅大大提高了分析速度，而且由于分 析的时候多个浓度、多个不同的ligand和analyte是 在完全相同条件下反应的，得到的结果最准确，重 复性也最好。点击索取更多技术资料！ ProteOn XPR36 系统分析小分子化合物采用 灵敏度最高的GLH 芯片。这种芯片的基质较长， 羧基位点较多，因此能结合较多的 ligand 蛋白， 而且蛋白活性保持较好。这样的芯片能够产生较高 的反应信号，非常适合分析小分子化合物。以下是 使用该款芯片分析蛋白和小分子化合物相互作用 的几个例子： CAII 蛋白和小分子抑制剂的相互作用： 首先将CAII 蛋白标记在GLH 芯片上。采用氨 基偶联，将CAII 蛋白用pH 5.0 的NaAc 溶解，标 2009年12月25日第七十一期 第 34 页，共 40 页 下一页 返回 小分子抗体（约150 KD）和几个抗原之间的相互 作用实验。每个实验的具体信息和反应曲线见下表 和下图： Rma M ka kd x 名称 K (M) D W (1/Ms) (1/s) (RU ) 24 1.99×1 0.09 4.77×10 DNP-glycine 6 -9 36