植物基因组中的连锁不平衡.pdfVIP

维普资讯 遗 fiHEREDITAS(BeijJng)2007年11月，29(11)：1317—1323 ISSN0253-9772 WWW．chinagene．on 综 述 DOI：10．1360／yc-007·1317 植物基因组中的连锁不平衡 王荣焕，王天宇，黎裕 中国农业科学院作物科学研究所，北京 100081 摘要：在植物基因组学研究领域，连锁不平衡(1inkagedisequilibrium，LD)分析是近年来的一个研究亮点和热 点。基于 LD的作图方法不仅是新基 因发掘的有效途径，而且也是联系结构基 因组学和表型组学的一座桥梁。 自2001年基于LD的作图方法在植物中的成功运用至今，已有大量关于植物基 因组中LD结构及 LD作图的研 究报道。文章系统介绍了LD的基本理论及其在LD作图、单倍型多样性分析，单倍型标签SNP的开发和群体 遗传学等研究中的应用，并就近年来关于LD与群体结构 ，基 因转换和上位效应及 G×E互作等方面的研究热 点和发展趋势进行 了探讨。当前，世界各国基 因争夺大战 日趋激烈。中国是基 因资源大国，但还不是基 因大国。 植物基因组中LD研究热潮的兴起及LD研究的进一步深入，必将大大推动植物基 因组学的快速发展，特别是加 速从作物种质资源中发掘新基因的进程。 关键词：连锁不平衡；LD结构；LD作图 Linkagedisequilibrium inplantgenomes WANG Rong—Huan，WANG Tian—Yu，LIYu InstituteofCropScience，ChineseAcademyofAgriculturalSciences，Bejiing100081，China Abstract： Linkagedisequilibrium (LD)isoneofthemostrecentlyfocusedinterestsinhtefieldofplantgenomics．LD mappingisna effectiveapproachtodiscoveringnovelgenesna dabridgeforconnectingstructuralgenomicstophenomics． LD mappingwasfirstappliedinplna ts in2001．Sincehten，researchesonhtestrucutrenadextentofLD nadLD mapping havebeenreportde inawiderangeofplnatspecies．ThebasichteoryofLD nadits applicationinLD mapping，haplotype diversityna alysis，htSNPidentificationnadpo pulationgeneticswerereviewedinhtispape r．Andadvna cesofLD reserach inplnats includinginfluencesofpo pulationstructure，geneconversion，epistasisnadGxEinteractions，nadfuutreprospects werealsopresentde．Chinahasabundna tgermplasm resources，butgenediscovery lagsbehind．IntensivereserachesonLD willcertainlyacceleraterapiddevelopmentofplna tgenomics，especiallyhteprogressofgenediscovery basde ongerm- plasm resourcesinChina． Keywords：linkagedisequilibrium (LD)；LDstructure；LDmapping 我 国现收集保存作物种质资源共 38万份，居世 基因大 国[11。抢 占基因种质资源制高点引发了基因 界第一位，是名副其实的基因资源大国，但还不是 争夺这