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- 约 49页
- 2019-04-14 发布于天津
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第三节 真核基因表达调控 ;真核细胞基因组全能性的实验证据 ; 真核细胞基因组的复杂性:
human genome: 约30亿 bp DNA;包含约3万个基因;95%的非编码DNA序列(功能?);
一生合成总蛋白质的种类约10万种,但在一个典型的分化细胞中合成约 5000 种蛋白质;如何调控?
人类基因组计划(HGP) 功能基因组学:基因及其产物(蛋白质)的功能;蛋白组学 (proteomics)。;从DNA到蛋白质的可能的调控步骤 ;真核细胞基因表达的不同调控水平示意图; 主要调控水平:
*-转录水平调控(transcriptional control)
*-转录后水平调控(post-transcriptional control)
RNA加工水平调控(RNA processing control)
翻译水平调控(translational control)
-蛋白质的翻译后修饰(post-translational modification); 一、转录水平的调控
基本概念:
事件:DNA/protein, protein/protein 相互作用;
顺式作用元件(cis-acting element):与转录调控蛋白特异
结合的DNA序列;
反式作用因子(trans-acting factor):与特定DNA序列结
合的调控蛋白因子;
“模体”结构(motif):蛋白质中的小结构域,由一小段保
守的氨基酸构成,用以识别特定的DNA序列或其他蛋白质;
e.g., helix-turn-helix, zinc-finger, ?-sheet, leucin-zip, etc.; 共有序列(consensus sequence):DNA中一小段保守序列(有时也指蛋白质中的氨基酸序列),能够被特定的蛋白结构域所识别,在转录起始调控中起重要作用;e.g., TATA-box, CAAT-box, GC-box, etc.
通用转录因子(general transcription factor):与核心启动子元件相结合(如TATA-box),启动转录;
特异转录因子(specific transcription factor):与基因的特异调控元件相结合,起调节作用(促进或阻抑);; 真核基因的结构;2,激活因子(activator)和辅激活因子(co-activator)
特异性的转录因子,能在DNA序列上形成复合体,激活转录;e.g., 肾上腺(糖)皮质激素的作用:glucocorticoid/GRE;转录因子(通用转录因子和特异转录因子)的功能结构域:
- DNA结合结构域(DNA-binding domain):与基因的
调控区域的特定DNA序列识别并结合
- 激活结构域(activation domain):招募其他激活因子
和蛋白质,共同启动或激活转录;真核基因转录的调控(gene control regions);3,基因远端的调控元件 — 增强子(enhancer)
特点:
距离基因的起始点较远
位置不定:上游、下游、内含子内部
方向性:正反方向均有作用
作用机制:
间隔 DNA 可以形成环状
通过与 enhancer 结合的特异因子起作用
染色质构型的改变(重塑);基因远端的增强子促进转录复合体的装配;转录激活机制的模型;(二)、转录的阻抑(transcriptional repression)
1,顺式作用元件/反式作用因子
阻抑物(repressor):负调控的特异性转录因子
沉默子(silencer):负调控的 DNA 元件
作用机制:
阻抑转录起始复合体的组装(与通用转录因子作用)
与转录激活因子竞争结合 DNA
与转录激活因子相互作用,影响其活性
改变染色质构型(招募重塑复合体、组蛋白修饰酶);阻抑因子(repressor)抑制基因转录的可能机制;(三)、基因转录的表观遗传调控(epigenetic control)
基本概念:
最近的研究已证实,基因组功能的正常行使,不仅依赖于DNA 序列中的遗传信息,还受到基因组中的其他信息的调控。
通过改变 DNA 和染色质结构来调控基因的转录。主要通过对 DNA 和/或组蛋白的共价修饰来实现。;修饰方式:
DNA:DNA 甲基化修饰 (DNA methylation) ;
核小体:组蛋白共价修饰 (histone
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