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生物大分子;本章主要介绍了氨基酸(AA)、Pr的基础知识。重点掌握AA、Pr的组成、性质、结构的特点及与功能之间的依存关系。了解常见的活性肽;了解蛋白质分离纯化及多肽化学合成的常用方法。;蛋白质(Protein,Pr)——生活细胞内含量最丰富、功能最复杂、参与几乎所有生命活动过程。即蛋白质是生命活动的体现者——结构功能、催化功能、免疫功能、转运功能、信息传递功能、运动功能、生物调控等功能;第3章 蛋白质;多肽是由氨基酸以酰胺键形式见解而成的线形大分子,在生物体内可以单独存在,但是更多的则作为蛋白质的组成成分,多肽之间通过共价键(主要是二硫键)或非共价键结合而成。;第3章 蛋白质3.2 氨基酸;氨基酸(Amino acid,AA):是羧酸分子中α-碳原子上的一个H被-NH2取代而成的化合物,作为蛋白质结构单元的氨基酸均为L-α-氨基酸,有20种——蛋白质氨基酸/基本氨基酸。 P33表3.1
有少数蛋白质含有不常见氨基酸——是基本氨基酸的衍生物;Amino acids are
the building blocks of proteins;1.除R为H(Gly)外,其余AA均具有不对称α-碳原子——AA有D/L-构型,但构成Pr的AA均为L-氨基酸,在生物界有D-氨基酸的存在。
2. AA具有不对称α-碳原子——AA具有旋光性
3.各种AA的区别在于侧链R基上;二十种常见蛋白质AA的分类与结构特点;甘氨酸 (Gly,G);芳香族氨基酸;酰胺族;酸性氨基酸;碱性氨基酸;非极性R基团氨基酸(Gly-Ala-Val-Leu-Ile-Phe-Met-Pro-Trp疏水性逐渐增大);极性不带电荷R基团氨基酸;带电荷R基团氨基酸;二十种氨基酸的结构特点
含支链AA:Val、Leu,Ile
含羟基的AA:Ser、Thr、(Tyr)
含硫的AA:Cys(含巯基)、Met(含硫甲基)
含苯环的AA:Phe、Trp、Tyr
含胍基的AA:Arg
含咪唑基的AA:His
亚氨基酸:Pro
含酰胺的AA:Asn、Gln
含吲哚基的AA:Trp
含ε-氨基的AA:Lys;AA的解离/酸碱性质 p34;p34;左图是Gly的电离酸碱滴定曲线,从左向右是用HCl滴定的曲线;从右向左是用NaOH滴定的曲线。曲线中从左向右第一个拐点是Gly羧基解离50%的状态,第二个拐点是Gly的pI,第三个拐点是Gly氨基解离50%状态;中性AA的pI计算: ;;;不常见(稀有)的AA;AA的化学反应 p37-45;甲醛滴定:用过量的中性甲醛与AA反应,可游离出H+,然后用NaOH滴定,从消耗的碱量可以计算出AA的含量。此法称为间接滴定法。;放出N2其一半来自氨基氮一半来自亚硝酸,测定N2的体积可计算AA的量.Pro(亚氨基)和Arg、His、Trp中的杂环结合N不能有此反应; Lysε-NH2反应很慢;可用于测定Pr的水解程度.;酰基化反应和烃基化反应——p38-39 苯甲酸、芥子气;磷酸吡哆醛的作用机理;脱氨基作用;转 氨 基 作 用;CH3;; 丙氨酸氨基转移酶(ALT);成盐、成酯反应;成酰胺反应;L-谷氨酸脱羧酶;叠(迭)氮反应;与茚三酮的反应:除Pro与Hyp外,可与其它AA生成蓝紫色化合物。Pro与Hyp在此反应中并不释放NH3,直接生成黄色化合物。在570nm(蓝紫色)或440nm(黄色)定量测定(0.5-50μg/ml) ;;氨基酸与茚三酮反应;脯氨酸与茚三酮反应的产物:;成肽反应; ;+;H2N—CH;二硫键可被氧化剂(过甲酸)或还原剂(巯基化合物——巯基乙醇)打开。;巯基乙醇;组成Pr的AA中Trp(280nm)、Tyr(275nm)、 Phe(257nm)对紫外光有一定的吸收(分子中含有苯环的共轭双键造成的),且都在280nm附近。 ;AA的化学合成 p45-49;Strecker 氨基酸合成法;还原氨化法——实际是一步完成,又称为仿生合成;α-溴/卤代羧酸氨化法 ;丙二酸酯合成法——应用较广,几乎可以合成所有重要的氨基酸 ;化学法;AA的化学合成 p45-49;Corey 法——利用不对称前体合成方法;利用铑络合物催化剂的不对称催化氢化反应;第3章 蛋白质3.3 多 肽;肽键和肽的结构;肽键(peptide bond):一个氨基酸的α-COOH 和相邻的另一个氨基酸的α-NH2脱水形成的共价键。;肽(链)(peptide chain):AA借肽键连接起来;N 末端:多肽链中有自由氨基的一端
C 末端:多肽链中有自由羧基的一端;肽键/酰胺平面——由于肽键不能自由旋转,肽链中从一个Cα原子到另一个Cα原子之间共包含的6个原子(Cα、C、O、N、H、Cα)在空间共处于同一个平面——肽/酰胺平面,是蛋白质空间构象的
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