水牛卵巢黄体形成和退化的蛋白质表达谱构建及生物信息学分析-生物资源.PDFVIP

生物资源 2018，40（5）：391~399 BioticResources DOI：10.14188/j.ajsh.2018.05.002 水牛卵巢黄体形成和退化的蛋白质表达谱构建及生物信息学 分析 † † ∗ 陈富美 ，姚 顺 ，陈东荣，徐壮壮，候 振，濮黎萍，张鹏飞，赵秀玲，张 明 （广西大学 亚热带农业资源保护与利用国家重点实验室，广西 南宁 530004） 摘要：本研究构建了水牛卵巢黄体形成及退化过程的定量蛋白质表达谱，从中寻找与水牛发情周期相关的重要蛋白质。 为研究水牛卵巢周期性变化的分子机制提供蛋白质水平的数据支撑，进而为提高水牛繁殖效率奠定实验基础。以水牛排卵后 的红体期（corpushemorrhagicum，CH）、黄体期（corpusluteum，CL）和白体期（corpusfibrosum，CF）的卵巢作为研究对象，利 用串联质谱标签（tandemmasstag，TMT）标记结合液质联用（（liquidchromatography/massspectrometry，LC⁃MS/MS）的定量 蛋白质组学技术，采用相关软件对得到的差异表达蛋白质进行生物信息学分析。同时对与水牛发情周期相关的重要差异蛋白 质：单核巨噬细胞分化抗原（CD14）、通用转录因子Ⅱ⁃Ⅰ（GTF2I）、羟基类固醇（17β）脱氢酶1（HSD17B1）、U6snRNA相关Sm 样蛋白质 （LSM1）和纤溶酶原激活物抑制物 （SERPINE1）进行了qRT⁃PCR分析验证。结果显示，共鉴定得到2 343种蛋白 质，其中差异表达蛋白质有284种（差异倍数≥2.0），初步构建了水牛卵巢黄体形成和退化的定量蛋白质表达谱。对其中的五 种重要差异蛋白质（CD14、GTF2I、HSD17B1、LSM1和SERPINE1）进行qRT⁃PCR验证，结果有四种（CD14、HSD17B1、 LSM1和SERPINE1）的qPCR结果与质谱结果相一致，仅GTF2I与质谱结果不一致，可能是由于GTF2I存在转录后调控。本 研究首次从蛋白质水平对水牛卵巢排卵后的周期性变化的分子机制进行了探究，同时为其他家畜品种发情周期的研究提供了 新的研究思路。 关键词：水牛；发情周期；黄体；定量蛋白质组学；生物信息学 中图分类号：S8 文献标识码：A 文章编号：2096⁃3491（2018）05⁃0391⁃09 Theproteinprofileandbioinformaticanalysisoftheformationandregression ofthecorpusluteuminbuffalo † † CHENFumei ，YAOShun ，CHENDongrong，XUZhuangzhuang，HOUZhen，PULiping， ∗ ZHANGPengfei，ZHAOXiuling，ZHANGMing （StateKeyLaboratoryforConservationandUtilizationofSubtropicalAgro⁃Bioresources，GuangxiUniversity，Nanning 530004， Guangxi，China） Abstract：BuffaloisanimportantsubtropicallivestockbreedinAsia，butitslowproductivitylimitsthecommercial⁃ izeddevelopment . Themainreasonisthattheoestrusperformanceoffemalebuffaloisnotobvious，anditsreproduction rategreatlydependsonthec