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第二期 多模态磁共振成像数据处理培训班(基础班)
2019.03.27-2019.03.31 (周三 ~ 周日)
主办单位:杭州拾睿科技有限公司
协办单位:杭州师范大学心理科学研究院
培训简介
近年来随着技术的不断发展,脑科学引起越来越多研究者的兴趣。磁共振作为一种安全无创的研究工具,已逐渐被广泛应用于神经、精神、消化、认知等医学和心理学领域,用于探索大脑发育、老化、情绪加工、运动障碍及记忆巩固等机制。通过分析磁共振影像数据,我们可以从不同角度去研究大脑结构及功能,并发表SCI文章。因此掌握磁共振数据处理技术变得越来越重要。
本期培训课程专门针对没有任何磁共振基础的学员,课程同时涵盖静息态数据分析、任务态数据分析以及结构像数据分析,让学员可以系统的掌握低频振幅(ALFF),局部一致性(ReHo)、基于图论的度中心度(DC)、功能连接(FC)、任务态数据分析、基于体素形态学分析(VBM)、独立成分分析(ICA)等磁共振数据分析方法。除了方法学外,本期培训班还详细的介绍了统计检验、多重比较校正、脑图制作以及各种脑科学实用工具。
为了让学员全面掌握以上技术并快速开展相应技术应用,我们的课程设计上不仅介绍理论,更注重实践操作。培训班内容丰富充实,并配备充足的助教,希望通过此次培训,能帮助到广大临床医生及科研工作者熟练掌握脑影像数据处理技能,从而在研究道路越走越远。
内容安排与特色
本期内容包括:
1)静息态功能磁共振数据预处理技术
2)局部一致性(ReHo)、低频振幅(ALFF)、比率低频振幅(fALFF)、度中心度(Degree centrality)、功能连接(Functional connectivity)等方法
3)统计检验、多重比较校正、做图、实用脑科学工具
4)基于体素的形态学分析(VBM)
5)独立成分分析原理及数据分析技术
6)任务态功能磁共振预处理技术
7)任务态功能磁共振数据一阶分析与二阶分析
本培训班课程设计重视实战操作,限制参加人数为19人,重点讲解软件使用及处理数据时常见问题,并提供丰富的例子数据,配备充足的助教,协助学员系统的掌握数据分析技术。参加培训的学员可以获得我们长期的技术服务和在线答疑。
本次培训班内容比较基础,适合零基础或对数据分析不是很了解的学员。
注:如果方便,请提前一天到会场2019年3月26日(13:30 - 18:00)安装软件、熟悉场地、拷贝资料等。
3. 课程安排
时间
课程名称
03月27日
(周三)
臧玉峰
9:00 - 10:00
静息态功能磁共振概论
贾 熙 泽
10:00 - 12:00
基础概念讲解
静息态数据整理与常见问题
数据分析前的准备工作
数据预处理讲解与实操
贾 熙 泽
14:00 - 17:00
ReHo指标计算以及相应预处理
ALFF及fALFF指标计算以及相应预处理
PerAF指标计算以及相应预处理
03月28日
(周四)
张 行
09:00 - 12:00
任务态fMRI介绍
简单任务的实验设计
SPM任务态数据预处理
张 行
14:00 - 17:00
SPM一阶分析
SPM二阶分析
上机操作
03月29日
(周五)
吕 亚 婷
9:00 - 12:00
VBM原理及介绍
数据准备及检查
VBM分析流程与操作
VBM统计分析
14:00 - 17:00
制作MASK
数据重采样
数值指标的提取
大脑指标与临床指标算相关
结果呈现于汇报
03月30日
(周六)
贾 熙 泽
9:00 - 12:00
基于种子点的功能连接
ROI wise功能连接
基于图论的指标度中心度的计算(Degree centrality)
14:00 - 17:00
单样本T检验
双样本T检验
配对样本T检验
单因素方差分析
脑图计算器(对脑图进行数学运算)
基于REST Viewer做图
03月31日
(周日)
胡 杨
9:00 - 12:00
使用ICA分析静息态fMRI数据(网络分析,多元分析)具体包括:
个体水平ICA算法原理
组水平ICA算法原理
使用ICA进行脑网络分析的常用指标(网络内功能连接、网络间功能连接)
14:00 - 17:00
使用GIFT进行ICA分析,具体包括:
使用GUI(图形界面)分析静息态数据的基本流程
使用SPM对ICA结果进行统计分析
GIFT其他常用小技巧(比如使用脚本进行分析,参数调试等)
备注:请各位学员自带笔记本电脑,建议电脑配置:windows 64位系统、4G以上内存、40G以上剩余硬盘空间
4. 授课老师
臧玉峰:医学博士。杭州师范大学认知与脑疾病研究中心教授。近年来一直从事静息态功能磁共振影像的计算方法学及其在认知与脑疾病的应用研究。与同事一道,提出“局部一致性”和“低频振幅”
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