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的测序方法、原理及其应用
;一、序列测定概述及其发展; 年,和等人第一次完成胰岛素个
氨基酸的序列测定,这在当时来说是一件了不起的大事。
年代后期,和等人又建立了核酸序
列测定的方法,双脱氧末端终止法和
化学裂解法将核酸序列测定技术推进到“直读”阶段,
使核酸序列测定变得远比蛋白质氨基酸序列测定容易,这样
人们可以通过核酸序列和遗传密码推导出蛋白质氨基酸的序
列。;二、测序的常用方法; )双脱氧链终止法测序( )
基本原理:
通过合成与单链互补的多核苷酸链,由于合成的互补链可在不同位置随机终止反应,产生只差一个核苷酸的分子,从而来读取待测分子的顺序。;用于终止反应的双脱氧核苷酸:
将’ ,’ –双脱氧核苷酸()参入到新合成的链中,由于参入的缺乏’ –羟基,因此不能与下一位核苷酸反应形成磷酸二酯键,合成反应将中止。;O;O;;) 化学降解法测序
基本原理:
① 用放射性核素标记待测一侧末端
② 将标记分为、、、 个反应体系
③ 用不同的化学试剂处理不同反应体系,随机断裂片段某种碱基中的任何一个,产生一组一端为放射线标记的末端,另一端为不同大小的片段的混合物
④ 电泳分离,放射自显影得到互相错落的梯形图谱,即可读出序列;;表特异断裂种脱氧核苷酸的方法;在种反应体系中,化学试剂特异地断裂的机制是:
反应硫酸二甲酯()使甲基化,其后断开了间的化学键,哌啶置换了被修饰鸟嘌呤与核糖的结合。
反应(哌啶)甲酸使嘌呤环上氮原子质子化,削弱了嘌呤脱氧核糖核苷酸和腺嘌呤脱氧核糖核苷酸的糖苷键,然后哌啶置换了嘌呤。
反应肼断开了嘧啶环,产生碱基片段被哌啶置换。
反应在存在时,只有才能与肼发生反应,随后,被修饰的胞嘧啶被哌啶置换。;★ 碱基特异性修饰及裂解;;) 自动化测序;三、种方法的比较;法只需简单化学试剂。所测序列来自原分子而不是酶促合成反应所产生的拷贝,因此利用化学法可以对合成的寡核苷酸进行测序,可以分析诸如甲基化等修饰的情况。但所能测定的长度要比法短一些,它对放射性标记末端 个核苷酸以内的序列效果最佳。
法虽需要单链模板和特异寡核苷酸,并需获得大肠杆菌 聚合酶 片段的高质量酶制剂,而随着 噬菌体和噬菌粒载体的发展,也由于现成的合成引物容易获得及测序反应日期完善,双脱氧链终止法如今远比法应用得广泛。
由于法既简便又快速,目前大多数测序策略都是为法而设计的。 ; 自动测序与手工测序的不同点;四、序列测定的应用;*;西南大学生物技术专业 基因工程;氨基酸序列同源性分析;碱基序列同源性;分子进化树分析亲缘性关系;西南大学生物技术专业 基因工程;谢谢!
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