酶催化-碳单元转移反应的理论研究-物理化学专业毕业论文.docx

山东大学2001届博士学位论文 山东大学2001届博士学位论文 题目：酶催化=壁兰垂堑堑垦壁塑堡丝堑堑 奠定基础。 论文的主要内容包括：辅酶及其模型化合物进行一碳单 元转移过程的量子化学研究，不同模型化合物反应活性的比 较，胸苷酸合成酶催化的一碳单元转移反应的模拟，甘氨酰胺 核苷酸转甲酰基酶催化的一碳单元转移反应的理论研究．_『 本论文共分五部分： ／ 、 第一章，(工作背景及理论方法简介二)简单介绍了量子生物 学的发展过程和研究的主要领域，总结了生物体内各种各样的 酶催化一碳单元转移反应过程，对酶催化一碳单元转移反应的 研究现状进行总结介绍，还扼要介绍了量子力学的理论背景和 完成论文所用到的理论计算方法。 第二章，5，10．CH+．TI-IF及其模型的一碳单元转移反 应。(本章首先用半经验分子轨道法(PM3方法)和从头计算与半 经验计算相结合的ONIOM方法对甲酸态模型——3．甲基．1 ．乙酰基咪唑啉盐的一碳单元转移反应进行计算，用PM3方 法计算了另一种模型化合物——3，4，4．三甲基．1．乙酰基 咪唑啉盐的一碳单元转移反应，还对5，10．CH+．nⅡ与邻苯 二胺的反应进行了理论研究，得到上述几个反应一碳单元转移 过程的详细机理和能量变化。结果表明：O计算方法对反应过 程的定性计算结果影响不大，不同的方法得到的结论非常接 近。②5，lO-cⅣ一唧及其模型化合物的甲酸态一碳单元(次 甲基CH兰)的转移具有相似的机理，反应过程中的能量变化略 有不同。③上述的次甲基的转移过程可以通过两种反应途径完 成，两条途径相互竞争。④每种反应途径都需要经历六个反应 步骤，这六个步骤是：反应物的结合，质子转移，五元咪唑环 摘 摘 要 的破裂，苯并咪唑环的形成，再一次质子转移，最终产物的生 成。⑤每种反应途径中的第二次质子转移是反应的限速步骤， 表明反应存在一般酸碱催化作用。⑥两种模型化合物3．甲基． 1．乙酰基咪唑啉盐与3，4，4．三甲基．1-乙酰基咪唑啉盐相 比较，C4位上的两个甲基对化合物构型影响很小，而对反应 过程的能量变化的影响较大。⑦模型在非酶催化条件下就可以 实现一碳单元的转移，而5，10．CH+．THF只能在酶催化下才 可能完成一碳单元的转移。! 第三章，5，10．CH，C+．T唧模型及其一碳单元转移反 应。l对模型化合物——2，3．二甲基一1．对氯苯磺酰基咪唑 啉盐向邻氨基苯酚转移甲基取代的次甲基(次乙基CH，C三)的反 应过程进行了理论研究，得到的反应机理与前面所述相似，而 且质子转移过程也是反应的限速步骤。计算发现，邻氨基苯酚 中氨基的活性比羟基更高，是首先向模型化合物进攻的基团。 通过对一类相似的模型化合物——2，3．二甲基．1．对位取 代苯磺酰基咪唑啉盐结构的计算，分析了不同取代基对反应活 性的影响。通过研究，得到了如下规律：2，3．二甲基．1．对 位取代苯磺酰基咪唑啉盐中苯磺酰基对位上取代基给电子能力 越强，咪唑啉环的共轭程度越高，N3和N6的差别越小，转 移一碳单元的反应活性越高。) 第四章，酶催化的甲酰基转移机理研究。对甘氨酰胺核苷 酸转甲酰基酶催化的一碳单元从叶酸辅酶向甘氨酰胺核苷酸转 移，生成甲酰甘氨酰胺核苷酸的机理进行了理论探讨。该一碳 单元转移反应有两种可能的机理，第一种为甘氨酰胺核苷酸上 的氨基先进攻5，10．CH+．n伍、后水解，第二种为5，10．CH+ 山东火学2001届博士学位论文 山东火学2001届博士学位论文 题目：酶催化一碳望重整整垦堕塑墨丝塑窒 一TⅢ先水解成10一CHO—THF，后接受甘氨酰胺核苷酸上氨 基的进攻。对反应过程中能量变化的分析可知，两种机理相互 竞争，而氨基先进攻、后水解过程的能量略低，可能是占优势 的机理。} 第五章，胸苷酸合成酶催化机理研究。f计算了酶对尿嘧啶 脱氧核糖核苷酸(dUMP)反应活性的影响，对甲醛氧化态的四 氢叶酸衍生物的开环过程进行理论研究，对胸苷酸合成酶催化 的一碳单元转移反应进行计算。结果显示，胸苷酸合成酶的作 用主要有三个方面：第一，使5，10一CH，一TⅢ活化生成高反 应活性的5=CH，+一THF，此过程中体系的能量有较大升高。 第二，胸苷酸合成酶使底物dUMP活化。虽然该过程的能量 变化不大，但是，这一过程使dUMP的C5位成为亲核中心， 引起电子结构的变化。第三，具有一般酸碱催化剂的作用，在 反应过程中(有时需要水分子的参与)起传递质子的作用。对5， 10一CH，一T研开环活化过程的研究显示，不同计算方法得到 相同的结论，该过程存在两种开环方式，分别为动力学和热力 学控制的过程。； 作者辱产之风 2001年4月 论文主置词：一碳单元转移，酶催化反应机理，叶酸辅酶 模拟研究，量子化学计算 ABSTRACTEnzymatic ABSTRACT