实验三基因组序列的模板.ppt

实验三：基因序列分析 ;实验项目三：基因序列分析 一、 实验目的和要求： 掌握基因可读框的识别； 掌握启动子区域的预测 掌握岛的预测 掌握转录终止信号的预测 采用序列预测基因：的使用 掌握各预测服务器结果的分析;原核生物基因结构;真核生物基因结构;基因组序列分析; ;;一 开放读码框的识别;基因开放阅读框基因结构分析识别工具;;;;;;;;;;基因、外显子及类型;;起始外显子;原核生物;原核生物;;启动子预测结果;三 岛预测;;从该序列的预测结果来看，找到两个CpG岛，分别位于501-727，长度为227个碱基，54380-54691，长度为312;四 转录终止信号;;转录终止信号预测;的使用及结果分析;的使用及结果分析;内含子外显子剪切位点识别;;剪切位点识别：;;序列在线提交形式： 界面中有两个窗口： 上方窗口用于输入基因组序列（直接粘贴序列或用 号） 下方窗口用于输入序??（直接粘贴序列或用 号） 可同时输入多条序列与同一条基因组序列进行分析;;第一条蓝色序列为基因组序列，橘黄色为外显子;;;使用 识别检索号为的可读框。写下拟南芥序列最长的的起止区间,并粘贴此编码的蛋白质序列的文件 使用对检索号为的序列进行基因预测，标出外显子区和位点，用对该序列进行预测，写出预测为外显子的序列区间。并比较两个服务器预测的结果是否一致，写出二者都预测为外显子的区段。;使用, , 对检索号为的核酸序列进行分析，识别序列中的功能元件，将预测结果（部分）进行截图，标出主要的结果。 使用 对检索号为的核酸序列进行分析，标出识别为外显子的区段。;实验报告;谢谢大家！