肝癌SMMC-7721细胞系HSF4调控的靶基因图谱分析-湖南师范大学.PDF

22 卷 3 期 生命科 研究 灾燥造援22 晕燥援3 年 月 圆园18 6 蕴蚤枣藻 杂糟蚤藻灶糟藻 砸藻泽藻葬则糟澡 Jun. 圆园18 DOI ：10.16605/ki.1007-7847.2018.03.004 肝癌SMMC-7721 细胞系HSF4 调控的靶基因 图谱分析 a b b b b* 马汝海 王天骄 潘忠诚 赵雨杰 何 群 , , , , ( 国医科大学a. 公共基础学院化学教研室; b. 基础医学院教育部细胞生物学重点实验室, 国辽宁沈阳 110122) 要 热休克转录因子4 (heat shock transcription factor 4, HSF4)是热休克转录因子HSF 家族成员, 近年发现 : HSF4 除发挥调控热休克蛋白(heat shock protein, HSP)表达的功能外, 亦直接或间接调节许多非热休克基因的 表达, 参与细胞生长发育多种生理病理过程 现通过染色质免疫共沉淀联合测序(chromatin immunoprecipita- tion sequencing, ChIP-Seq)方法对HSF4 潜在的靶基因进行检测, 并用GO (gene ontology)分析方法对这些靶基 因进行分析, 以探求HSF4 发挥的生物 功能 ChIP-Seq 结果显示: 在肝癌SMMC-7721 细胞系基因组DNA 中 共有1 726 个HSF4 结合区域, 其中102 个在启动子区 GO 分析结果显示: 这些潜在的靶基因分别参与细胞发 育 增殖和对外部刺激应答的生物过程, 具有与核酸和蛋白质结合及蛋白质激活的分子功能, 参与药物和有害 尧 异物代谢以及化学致癌的信号传导通路 此外, MEME4.12.0 软件推测出在SMMC-7721 细胞系中HSF4 与 DNA 启动子区结合的6 种模式 分析HSF4 在肝癌SMMC-7721 细胞系中可能调控的靶基因图谱为进一步研 究HSF4 在肝癌发生机制中的作用提供了有效的实验数据和理论基础 关键词 热休克转录因子4 (HSF4); 肝肿瘤; 染色质免疫共沉淀联合测序(ChIP-Seq); 靶基因; GO 分析 : 中图分类号 Q617 文献标识码 A 文章编号 1007 7847(20 18)03 0201 07 : : : - - - Target Gene Mapping Analysis of HSF4 Regulation in Hepatocellular Carcinoma SMMC-7721 Cells a b b b b* MA Ru-hai , WANG Tian-jiao , PAN Zh