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- 2019-05-11 发布于上海
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Cloning and Functional Analysis of the Pathogenic Related gene Mzbot in Metarhizium anisopliae
A Thesis Submitted to Chongqing University in Partial Fulfillment of the Requirement for the
Degree of Master of Science
By Mingjing Gao
Supervised by Prof. Yuxian Xia Major: Biology
College of Bioengineering of Chongqing University, Chongqing, China
December, 2011
中文摘要
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重庆大学硕士学位论文
重庆大学硕士学位论文
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摘 要
绿僵菌(Metarhizium anisopliae)又名黑僵菌,是一种常见的丝状真菌,有着 广泛的地理分布,也是国内外生物防治中应用广泛的昆虫病原真菌之一。绿僵菌 具有一定的专一性,对人畜无害,同时还具有不污染环境、无残留、害虫不会产 生抗药性等优点。随着绿僵菌基因组测序的完成,使其更成为一种研究虫生真菌 的模式生物。迄今,关于真菌的致病机制的研究广泛,而关于虫生真菌致病相关 基因的研究亦十分活跃。这是由于绿僵菌致病力弱,货架期短,环境依赖性强严 重制约了绿僵菌杀虫真菌农药的发展。致病基因、耐胁迫基因的研究将为菌株改 造提供基因资源。
本实验从绿僵菌 CQMa102 在蝗虫翅膀生长时期与在蝗虫体内生长时期的差 减 cDNA 文库中选取了一个高表达基因 EST 序列,WTEA78。根据这个 EST 序列, 我们从绿僵菌全长 cDNA 文库中克隆了这个基因 Mzbot,该基因 cDNA 序列全长 1251bp, 与费希新萨托菌的 zinc-binding oxidoreductase ToxD 基因具有较高的同源 性,同时利用 RNAi 和超表达的方法,通过减少或增加基因的表达量后绿僵菌变异 表型,研究了 Mzbot 的功能。得到的主要实验结果如下:
1.绿僵菌 Mzbot 基因的克隆、序列分析和表达情况 克隆了蝗虫翅膀上特异高表达基因 Mzbot 的 cDNA 全长,进行了生物信息分
析,并通过 RT-PCR 对其侵染蝗虫过程中的表达模式进行了分析。
Mzbot 基因 cDNA 片段全长 1251bp,包括一个 1089bp 的开放阅读框,69bp 的 5’非翻译区,93bp 的 3’非翻译区。该 cDNA 序列的 Genebank accession number 为 HQ011919。与绿僵菌 CQMa102 全基因组序列比对,获取了 Mzbot 基因的基因 组 DNA 序列。将 DNA 序列与 cDNA 序列用 DNAMAN 软件比对,结果表明:Mzbot 基因组 DNA 全长 1478bp,含有 4 个外显子和 3 个内含子,内含子位置为
(283bp-381bp、661bp-715bp、800bp-866bp),其边界皆符合 GT-AG 规则。 在线预测该基因编码 362 个氨基酸,预测蛋白质分子量 Mw=39336.81u (当
Cys 处 于 还 原 状 态 时 ); 理 论 等 电 点 pI=5.41 属 于 酸 性 蛋 白 质 ; 其 分 子 式 为 C1786H2772N456O530S7;负电荷残基 (Asp + Glu) 47 个,正电荷残基(Arg + Lys)39 个, 平均亲水性(GRAVY): -0.135,是一个亲水蛋白;不稳定指数(Instability index )19.67, 为稳定的蛋白质。同费希新萨托菌的 zinc-binding oxidoreductase ToxD 基因具有较 高的同源性(51 % identity,E-Value 值为 6e-85)。与其他真菌已知或推测的 zinc-binding oxidoreductase ToxD 也有较高的同源性。在线分析推测编码蛋白不含 有信号肽,没有定向到线粒体的导肽,也没有核定位信号 Nuclear Localization
Signals (NLS),定位在细胞质。
生物信息学预测表明该蛋白没有显著的跨膜结构区域,这与生物信息学定位 一致,在 163 位氨基酸处(NKTV)有一个 N-糖基化位点(N-glycosylation site);在 12 与 223 位氨基酸处(RKAT)各有一个 cAMP- 与 cGMP-依赖的蛋白激酶磷酸 化位点;在 195、242、251
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