分子生物学 第五章.pptVIP

第五章  真核生物转录起始 第一节 真核细胞核 真核细胞核 染色质(chromatin) 常染色质(euchromatin)与异染色质(heterchromatin) 组成性异染色质和兼性异染色质 核基质 核基质与染色质核基质连接区域 结构域、功能域和DNA酶I敏感区域 第二节 染色质结构 染色质结构调控基因组表达的方式 绝缘子（insulator） 绝缘子与异染色质扩展 绝缘子维持功能域独立性 基因座控制区(locus control region, LCR)与调控结构域 核小体重建—能量依赖 组蛋白修饰 DNA甲基化 第三节  DNA结合蛋白 染色质化学组成 DNA结合蛋白 DNA结合蛋白的结构特征—以转录因子为例 DNA结合结构域常见类型 第四节 转录起始中DNA与蛋白质相互作用 DNA-蛋白质相互作用是转录调控的方式 顺式调控元件 启动子(promoter) 真核启动子 增强子(enhancer) RNA聚合酶 基础转录因子(basal transcription factor) 转录起始事件 RNA聚合酶II的转录起始（1） RNA聚合酶II的转录起始（2） RNA 聚合酶I, 转录28S, 5. 8S 和18S 核糖体 RNA (rRNA) RNA 聚合酶Ⅱ，负责真核生物蛋白编码基因和大部分小核RNA（snRNA)的转录，有7-10 个亚基，最大亚基的羧基末端结构域(CTD)具有7 个氨基酸(Tyr-Ser-Pro-Thr-Ser-Pro-Set)的重复序列，其中有多个磷酸化位点．CTD 磷酸化对调控基因转录有重要作用． RNA 聚合酶III,转录tRNA, 5S rRNA, U6-snRNA, 小核仁RNA (snoRNA), 小细胞质 RNA (seRNA) 真核基因转录除 RNA 聚合酶外，还需要许多蛋白因子—转录因子参加，其中一些转录因子是RNA 聚合酶Ⅱ转录起始必需的，并且可以维持基础水平的转录，因此称为基础转录因子或普通转录因子(general transcription factor) RNA 聚合酶 II 的普通转录因子(TF II)包括TFIID,TFⅡB,TFIIF，TFIIE，TFIIH，TFIIA 等． TFIID 是最先结合到DNA上的转录因子，由TATA结合蛋白（TATA-binding protein, TBP)和12个TBP相关因子（TAF, TBP-associated factor)组成 RNA 聚合酶结合核心启动子 封闭的启动子复合物转换为开放的启动子复合物 RNA合成的起始 启动子清除：聚合酶向启动子下游移动 * * 真核生物细胞中细胞核内DNA和蛋白质高度包装的紧密复合体结构。 染色质的低水平包装：核小体和30nm螺旋管纤维是分裂间期细胞核染色质形式。（松散） 中期染色体是最高水平的压缩。 常染色质，是指间期核内染色质纤维折叠压缩程度地处于伸展状态，用碱性染料染色时着色浅的那些染色质。是基因转录的必要条件，也就是说不是常染色质的所有基因都转录。 异染色质，是指在间期细胞核中，仍然高度折叠的、用碱性染料染色着色深的一部分染色质。它们不转录而且复制较晚。 组成性异染色质（constitutive heterchromatatin),是指所有细胞中永久存在的异染色质。其DNA不含基因，包括着丝粒、端粒等特定区域的DNA。 兼性异染色质（facultative heterchromatatin), 是指在某些细胞类型的一定阶段出现的高度聚缩，丧失基因转录活性的DNA。一般胚胎细胞含量较少，而告独特化的细胞含量较多。这种兼性染色质，实际上是基因组活性调控的一种形式。 核基质(nuclear matrix),细胞核内除核膜、染色质、核仁和核孔外的骨架结构。 常染色质中附着于基质上的DNA区域，富含AT，称为基质相关区域(matrix-associated region, MAR)或骨架附着区(scaffold attachment region, SAR) 连接在核基质上的DNA环，称为结构域。 功能域，也称为活性染色质，具有转录活性的染色质，即表达基因周围的DNA区域。 活性染色质对DNA酶I消化作用更敏感。这些敏感位点常位于基因5’端启动子区域。 染色质结构的区间性 1）绝缘子 2）基因座控制区（LCR） 染色质结构改变 1）核小体重建 2）组蛋白修饰：乙酰化、甲基化、磷酸化 3）DNA甲基化 4）异染色质扩展 功能域中或功能域间，阻断基因激活或失活效应的元件 当其位于增强子和启动子之间的时候，能阻断增强子对启动子的激活作用 异染色质扩展，异染色质在特殊的序列生成核心，随后沿染色质纤维传播阻断启动子 当绝缘子位于一条活性基因和