教案大肠杆菌基因组DNA的提取与电泳鉴定-长沙医学院.DOCVIP

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教 案 2012 ~ 2013 学年第 1 学期 课 程 名 称 生物化学实验 开 课 系 部 基础医学系 开 课 教 研 室 生物技术 授 课 教 师 赵娟 职 称 助教 授 课 班 级 生物技术 学 生 人 数 长 沙 医 学 院 教 务 处 制 长 沙 医 学 院 教 案 课程名称 生物化学实验 授课题目(章节或主题) 大肠杆菌基因组DNA的提取与电泳鉴定 授课教师 赵娟 所属系(部) 基础医学系 所属教研室 生物技术 职称 助教 授课时间 2012 年 11 月 15日第13周星期4 第 6- 授课时数 5学时 授课班级 生物技术 专业(本科 eq \o\ac(□,√) 专科□) 2010 级 1 班 教学课型 理论课□ 实验课 eq \o\ac(□,√) 见习课□ 习题课□ 讨论课□ 其它□ 教材名称、作者、出版社及出版时间 《基础生物化学实验》,高等教育出版社,魏群,2009 教学目的要求: 1. 掌握DNA提取的原理和方法; 2. 掌握琼脂糖凝胶电泳检测DNA的方法 重点与难点: 重点:大肠杆菌基因组DNA快速提取的原理;大肠杆菌基因组DNA快速提取的方法;琼脂糖凝胶电泳检测DNA的方法 难点:大肠杆菌基因组DNA快速提取的原理;琼脂糖凝胶电泳检测DNA的方法 教学方法(请打√选择): 讲授法□ 讨论法□ 启发式□ 自学辅导法□ 练习法(习题或操作) eq \o\ac(□,√) 读书指导法□ PBL(以问题为中心的教学法)□ 其他□ 教学手段(请打√选择): 板书 eq \o\ac(□,√) 实物□ 标本□ 挂图□ 模型□ 投影□ 幻灯 eq \o\ac(□,√) 录像□ CAI(计算机辅助教学)□ 教学过程设计和教学内容:多媒体教学,讲授法、启发式提问法 教学内容: 大肠杆菌基因组DNA的提取 原理 本实验利用溶菌酶和碱裂解液SDS使细胞壁破坏,利用氯仿抽提的方法去除蛋白质,得到的DNA溶液利用乙醇将DNA沉淀下来。 材料、试剂、仪器 实验菌株:大肠杆菌 试剂:TE溶液:Tris?HCl 10 mM,EDTA 1 mM 20% SDS: 溶菌酶(50mg/ml) 5M NaCl 氯仿:异戊醇(24:1 v/v) 无水乙醇 0.8%琼脂糖 TAE电泳缓冲液 仪器:离心机,电泳仪 实验步骤: 取1.5ml培养好的大肠杆菌培养液与离心管中,7,000 rpm离心5 min,弃上清; 加入500ul TE溶液洗涤菌体7,000 rpm离心5 min,弃上清; 用360ul TE溶液悬浮菌体,加入20ul 溶菌酶(50mg/ml),37°C 加入40ul 20 %SDS使其终浓度为2 %,60°C水浴30min。 加入110ul 5 M 高氯酸钠 使其终浓度为1 M,充分混匀; 加入等体积氯仿:异戊醇(24:1 v/v),充分混匀,4°C 12,000 rpm 离心15min,吸取上清于一新离心管中; 加入2倍体积的无水乙醇,混匀后12000rpm 离心10min; 弃上清,离心管在空气中自然晾干; 加入30-40ul TE溶解DNA; 取3-5ul DNA溶液,琼脂糖电泳检测。 琼脂糖电泳检测 原理 由于DNA结构的重复性,核苷酸数相同的DNA几乎具有等量的净电荷,所以核酸携带的电荷的差异几乎不造成对核酸迁移率的差异,而真正决定DNA分子在某一特定电场下的电泳迁移率因素取决于DNA分子的大小、构象、构型。采用适当浓度的琼脂糖凝胶或聚丙烯酰胺凝胶介质作为电泳支持物,发挥分子筛的功能,使大小、构象不同的核酸分子泳动率出现较大差异,以达到分离的目的。 材料、试剂和仪器 细菌基因组DNA 琼脂糖、6×Loading Buffer、DNA分子量marker、溴化乙啶(EB) 3. 仪器:琼脂糖凝胶电泳系统、凝胶成像系统 实验步骤 凝胶的制备 配0.7%的胶:称取0.21g的琼脂糖,置于三角瓶中,加入1×TAE 30ml,盖上铝箔纸,放在微波炉中化胶,注意用中低火(约1~2分钟),避免沸腾和溢出。 轻旋转三角

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