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教 案
2012 ~ 2013 学年第 1 学期
课 程 名 称 生物化学实验
开 课 系 部 基础医学系
开 课 教 研 室 生物技术
授 课 教 师 赵娟
职 称 助教
授 课 班 级 生物技术
学 生 人 数
长 沙 医 学 院 教 务 处 制
长 沙 医 学 院 教 案
课程名称
生物化学实验
授课题目(章节或主题)
大肠杆菌基因组DNA的提取与电泳鉴定
授课教师
赵娟
所属系(部)
基础医学系
所属教研室
生物技术
职称
助教
授课时间
2012 年 11 月 15日第13周星期4 第 6-
授课时数
5学时
授课班级
生物技术 专业(本科 eq \o\ac(□,√) 专科□) 2010 级 1 班
教学课型
理论课□ 实验课 eq \o\ac(□,√) 见习课□ 习题课□ 讨论课□ 其它□
教材名称、作者、出版社及出版时间
《基础生物化学实验》,高等教育出版社,魏群,2009
教学目的要求:
1. 掌握DNA提取的原理和方法;
2. 掌握琼脂糖凝胶电泳检测DNA的方法
重点与难点:
重点:大肠杆菌基因组DNA快速提取的原理;大肠杆菌基因组DNA快速提取的方法;琼脂糖凝胶电泳检测DNA的方法
难点:大肠杆菌基因组DNA快速提取的原理;琼脂糖凝胶电泳检测DNA的方法
教学方法(请打√选择):
讲授法□ 讨论法□ 启发式□ 自学辅导法□ 练习法(习题或操作) eq \o\ac(□,√) 读书指导法□ PBL(以问题为中心的教学法)□ 其他□
教学手段(请打√选择):
板书 eq \o\ac(□,√) 实物□ 标本□ 挂图□ 模型□ 投影□ 幻灯 eq \o\ac(□,√) 录像□ CAI(计算机辅助教学)□
教学过程设计和教学内容:多媒体教学,讲授法、启发式提问法
教学内容:
大肠杆菌基因组DNA的提取
原理
本实验利用溶菌酶和碱裂解液SDS使细胞壁破坏,利用氯仿抽提的方法去除蛋白质,得到的DNA溶液利用乙醇将DNA沉淀下来。
材料、试剂、仪器
实验菌株:大肠杆菌
试剂:TE溶液:Tris?HCl 10 mM,EDTA 1 mM
20% SDS:
溶菌酶(50mg/ml)
5M NaCl
氯仿:异戊醇(24:1 v/v)
无水乙醇
0.8%琼脂糖
TAE电泳缓冲液
仪器:离心机,电泳仪
实验步骤:
取1.5ml培养好的大肠杆菌培养液与离心管中,7,000 rpm离心5 min,弃上清;
加入500ul TE溶液洗涤菌体7,000 rpm离心5 min,弃上清;
用360ul TE溶液悬浮菌体,加入20ul 溶菌酶(50mg/ml),37°C
加入40ul 20 %SDS使其终浓度为2 %,60°C水浴30min。
加入110ul 5 M 高氯酸钠 使其终浓度为1 M,充分混匀;
加入等体积氯仿:异戊醇(24:1 v/v),充分混匀,4°C 12,000 rpm 离心15min,吸取上清于一新离心管中;
加入2倍体积的无水乙醇,混匀后12000rpm 离心10min;
弃上清,离心管在空气中自然晾干;
加入30-40ul TE溶解DNA;
取3-5ul DNA溶液,琼脂糖电泳检测。
琼脂糖电泳检测
原理
由于DNA结构的重复性,核苷酸数相同的DNA几乎具有等量的净电荷,所以核酸携带的电荷的差异几乎不造成对核酸迁移率的差异,而真正决定DNA分子在某一特定电场下的电泳迁移率因素取决于DNA分子的大小、构象、构型。采用适当浓度的琼脂糖凝胶或聚丙烯酰胺凝胶介质作为电泳支持物,发挥分子筛的功能,使大小、构象不同的核酸分子泳动率出现较大差异,以达到分离的目的。
材料、试剂和仪器
细菌基因组DNA
琼脂糖、6×Loading Buffer、DNA分子量marker、溴化乙啶(EB)
3. 仪器:琼脂糖凝胶电泳系统、凝胶成像系统
实验步骤
凝胶的制备
配0.7%的胶:称取0.21g的琼脂糖,置于三角瓶中,加入1×TAE 30ml,盖上铝箔纸,放在微波炉中化胶,注意用中低火(约1~2分钟),避免沸腾和溢出。
轻旋转三角
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