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NGS实验室建设标准与要求|喜格.doc

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高通量测序临床基因检测实验室建设方案|喜格 NGS实验室建设标准与要求 一、高通量测序( NGS)实验室简介 NGS实验室又叫高通量测序检测实验室。 NGS是下一代测序技术 ( NEXT GENERATIONSEQUENCIN)G即高通量测序技术的简称。高通量测序技术是对传 统 SANGER测序(称为一代测序技术)革命性的改变 , 可同时对几十万到 几百万条核酸分子进行序列测定, 同时高通量测序使得对一个物种的转 录组和基因组进行细致全貌的分析成为可能 , 也称为深度测序 (DEEP SEQUENCIN)G。 由于 NGS技术对所检测的核酸模板进行大量扩增, 容易出现实验室污染 导致检测结果准确性下降;另外 NGS技术要求高、影响因素多,实验过 程处理不当易导致检测结果准确性下降或检测失败。 因此临床基因扩增 检验实验室技术验收和规范化管理是 NGS技术本身需要, 也是在临床上 顺利应用该技术前提。 二、NGS实验室临床应用的基本条件 必须拥有符合临检中心相关规定的标准 NGS实验室。 检测设备必须符合标准 NGS实验室设置要求: 高通量测序仪及配套服务 器;高通量测序检测试剂盒;通用电脑;自动分析软件,实验室样本信 息管理系统等。 检测人员必须通过专门的技能培训, 并获得省级以上卫生计生行政部门 颁发的临床基因扩增检验技术上岗证书。 NGS实验室必须建立严格的实 验室管理制度、建立标准化操作程序( SOP)、建立系列质量管理文件 等,确保实验室日常运行符合国家卫生部的要求,确保检测结果准确、 确保实验室卫生安全,确保实验室长期稳定运行。 NGS临床应用必须在无菌无尘环境下进行操作。 三、NGS实验室建设基本要求 主体结构 1 / 12 高通量测序临床基因检测实验室建设方案|喜格 主体为彩钢板、铝合金型材。室内所有阴角、阳角均采用铝合金 50 内圆角 铝,从而解决容易污染、积尘、不易清扫等问题。结构牢固,线条简明,美 观大方,密封性好。 标准的各区分隔和气压调节 将检测过程分成试剂准备、样本制备、 PCR扩增和高通量测序四个独立的实 验区。整个区域有一个整体缓冲走廊。每个独立实验区设置有缓冲区, 同 时各区通过气压调节, 使整个检测实验过程中试剂和标本免受气溶胶的污染 并降低扩增产物对人员和环境的污染。 可打开缓冲区和 PCR扩增区的排风扇往外排气,在实验区的外墙上和各扇 门上都安装有风量可调的回风口,空气通过回风口向室内换气。 消毒 在每个实验区和缓冲区顶部以及传送窗内部安装有紫外灯,供消毒用。在各 区还设置移动紫外线灯,对实验桌进行局部消毒。 机械连锁不锈钢传递窗 试剂和标本通过机械连锁不锈钢(不建议使用电子连锁方式)传递窗传递, 保证试剂和标本在传递过程中不受污染(人物分流)。 地面 地面建议使用 PVC卷材地面或自流坪地面,整体性好。便于进行清扫,耐腐 蚀。没有条件的也可采用水磨石地面,或大块的瓷砖(至少 800MM× 800MM) 接缝需要小于 2MM。 照明 灯具要选用净化灯具,能达到便于清洗、不积尘的特点。 平面布局 2 / 12 高通量测序临床基因检测实验室建设方案|喜格 NGS实验室应根据自己的检验项目、所采用的检测技术平台和工作量来决定 分区的多少及各区域的空间大小, 至少具体需要多少个区, 同样是“个体化” 的,以“工作有序、互不干扰、防止污染、报告及时”作为基本原则。 四、各项目实验室建设标准 产前筛查与产前诊断(全基因组低拷贝测序技术) 实验室平面图 图 1:产前筛查与诊断实验室平面图 技术流程图 图 2:产前筛查与诊断技术流程图 3 / 12 高通量测序临床基因检测实验室建设方案|喜格 技术参数 分区 压力 温度 相对湿度 照明 专用走廊 0Pa 缓冲区 +5Pa 试剂准备室 +15Pa 标本与文库制 备区 +10Pa 20-25℃ 40%~60% 主实验室≥ 300LX,其 余房间 200~300LX 文库扩增与检 -5Pa 测区 测序区 -10Pa 分区功能 试剂准备室 主要功能:在 NGS过程中使用到的试剂的配制、分装和保存。 标本与文库制备区 主要功能:血液处理、血浆制备、 DNA提取、DNA片段化、DNA样品的纯化、 DNA浓度检测、末端修复、接头连接、构建样本的测序文库。 文库扩增与检测区 主要功能:文库构建后的 PCR扩增与纯化、文库浓度检测、文库的混合及混 合后的质检分析。 测序区 主要功能:测序模板制备(乳液 PCR与磁珠富集回收)、上机测序、数据分 析、报告审核及发放。 仪器配置 试剂准备室 4 / 12 高通量测序临床基因检测实验室建设方案|喜格 主要仪器设备:加样器、冰箱、分析天平、微量台式离心机、涡旋振荡器、 移液器、可移动紫

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