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高通量测序临床基因检测实验室建设方案|喜格
NGS实验室建设标准与要求
一、高通量测序( NGS)实验室简介
NGS实验室又叫高通量测序检测实验室。 NGS是下一代测序技术 ( NEXT
GENERATIONSEQUENCIN)G即高通量测序技术的简称。高通量测序技术是对传
统 SANGER测序(称为一代测序技术)革命性的改变 , 可同时对几十万到
几百万条核酸分子进行序列测定, 同时高通量测序使得对一个物种的转
录组和基因组进行细致全貌的分析成为可能 , 也称为深度测序 (DEEP
SEQUENCIN)G。
由于 NGS技术对所检测的核酸模板进行大量扩增, 容易出现实验室污染
导致检测结果准确性下降;另外 NGS技术要求高、影响因素多,实验过
程处理不当易导致检测结果准确性下降或检测失败。 因此临床基因扩增
检验实验室技术验收和规范化管理是 NGS技术本身需要, 也是在临床上
顺利应用该技术前提。
二、NGS实验室临床应用的基本条件
必须拥有符合临检中心相关规定的标准 NGS实验室。
检测设备必须符合标准 NGS实验室设置要求: 高通量测序仪及配套服务
器;高通量测序检测试剂盒;通用电脑;自动分析软件,实验室样本信
息管理系统等。
检测人员必须通过专门的技能培训, 并获得省级以上卫生计生行政部门
颁发的临床基因扩增检验技术上岗证书。 NGS实验室必须建立严格的实
验室管理制度、建立标准化操作程序( SOP)、建立系列质量管理文件
等,确保实验室日常运行符合国家卫生部的要求,确保检测结果准确、
确保实验室卫生安全,确保实验室长期稳定运行。
NGS临床应用必须在无菌无尘环境下进行操作。
三、NGS实验室建设基本要求
主体结构
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高通量测序临床基因检测实验室建设方案|喜格
主体为彩钢板、铝合金型材。室内所有阴角、阳角均采用铝合金 50 内圆角
铝,从而解决容易污染、积尘、不易清扫等问题。结构牢固,线条简明,美
观大方,密封性好。
标准的各区分隔和气压调节
将检测过程分成试剂准备、样本制备、 PCR扩增和高通量测序四个独立的实
验区。整个区域有一个整体缓冲走廊。每个独立实验区设置有缓冲区, 同
时各区通过气压调节, 使整个检测实验过程中试剂和标本免受气溶胶的污染
并降低扩增产物对人员和环境的污染。
可打开缓冲区和 PCR扩增区的排风扇往外排气,在实验区的外墙上和各扇
门上都安装有风量可调的回风口,空气通过回风口向室内换气。
消毒
在每个实验区和缓冲区顶部以及传送窗内部安装有紫外灯,供消毒用。在各
区还设置移动紫外线灯,对实验桌进行局部消毒。
机械连锁不锈钢传递窗
试剂和标本通过机械连锁不锈钢(不建议使用电子连锁方式)传递窗传递,
保证试剂和标本在传递过程中不受污染(人物分流)。
地面
地面建议使用 PVC卷材地面或自流坪地面,整体性好。便于进行清扫,耐腐
蚀。没有条件的也可采用水磨石地面,或大块的瓷砖(至少 800MM× 800MM)
接缝需要小于 2MM。
照明
灯具要选用净化灯具,能达到便于清洗、不积尘的特点。
平面布局
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高通量测序临床基因检测实验室建设方案|喜格
NGS实验室应根据自己的检验项目、所采用的检测技术平台和工作量来决定
分区的多少及各区域的空间大小, 至少具体需要多少个区, 同样是“个体化”
的,以“工作有序、互不干扰、防止污染、报告及时”作为基本原则。
四、各项目实验室建设标准
产前筛查与产前诊断(全基因组低拷贝测序技术)
实验室平面图
图 1:产前筛查与诊断实验室平面图
技术流程图
图 2:产前筛查与诊断技术流程图
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技术参数
分区 压力 温度 相对湿度 照明
专用走廊 0Pa
缓冲区 +5Pa
试剂准备室 +15Pa
标本与文库制
备区
+10Pa
20-25℃ 40%~60%
主实验室≥ 300LX,其
余房间 200~300LX
文库扩增与检
-5Pa
测区
测序区 -10Pa
分区功能
试剂准备室
主要功能:在 NGS过程中使用到的试剂的配制、分装和保存。
标本与文库制备区
主要功能:血液处理、血浆制备、 DNA提取、DNA片段化、DNA样品的纯化、
DNA浓度检测、末端修复、接头连接、构建样本的测序文库。
文库扩增与检测区
主要功能:文库构建后的 PCR扩增与纯化、文库浓度检测、文库的混合及混
合后的质检分析。
测序区
主要功能:测序模板制备(乳液 PCR与磁珠富集回收)、上机测序、数据分
析、报告审核及发放。
仪器配置
试剂准备室
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高通量测序临床基因检测实验室建设方案|喜格
主要仪器设备:加样器、冰箱、分析天平、微量台式离心机、涡旋振荡器、
移液器、可移动紫
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