隆头鱼类线粒体全基因组序列分析及系统发育关系探讨-海洋生物学专业毕业论文.docxVIP

浙江海洋大学 浙江海洋大学 论文原创性声明 本人声明，所呈交的学位论文系在导师指导下本人独立完成的 研究成果。文中依法引用他人的成果，均己做出明确标注或得到许 可。论文内容未包含法律意义上已属于他人的任何形式的研究成果， 也不包含本人已用于其他学位申请的论文或成果。 本人如违反上述声明，愿意承担以下责任和后果： 1．交回学校授予的学位证书； 2．学校可在相关媒体上对作者本人的行为进行通报； 3．本人按照学校规定的方式，对因不当取得学位给学校造成的名 誉损害，进行公开道歉； 4．本人负责因论文成果不实产生的法律纠纷。 、 I 论文作者签名： 彩(及呻 日期：沙／6年／月≥日 万方数据 浙江海洋大学 浙江海洋大学 论文知识产权权属声明 本人在导师指导下所完成的论文及相关的职务作品，知识产权 归属浙江海洋大学。学校享有以任何方式发表、复制、公开阅览、 借阅以及申请专利等权利。本人离校后发表或使用学位论文或与该 论文直接相关的学术论文或成果时，署名单位仍然为浙江海洋大学。 学位论文作者签名：易依w扣指导教师签名： 日期： 矽‘么年6月日 日期：1／彳r年磊3日 万方数据 中国博士学位论文全文数据库》、中国优秀硕士学位论文全文数据库》 中国博士学位论文全文数据库》、中国优秀硕士学位论文全文数据库》 和{：万方硕博论文库》投稿声明 研究生处： 本人同意《中国博士学位论文全文数据库》和《中国优秀硕士 学位论文全文数据库》出版章程的内容，愿意将本人的学位论文委 托研究生处向中国学术期刊(光盘版)电子杂志社的《中国博士学位 论文全文数据库》、 《中国优秀硕士学位论文全文数据库》和《万 方数据电子出版社》投稿，希望《中国博士学位论文全文数据库》、 《中国优秀硕士学位论文全文数据库》和《万方数据电子出版社》 给予出版，并同意在《中国优秀博硕士学位论文全文数据库》、《中 国优秀硕士学位论文全文数据库》和《万方数据电子出版社》以及 CNI【I系列数据库中使用，同意按章程规定享受相关权益。 嚣拓篡幂≥学位敝作者签名：犯呻指导教师签名：√7一了臌名：J孑呼 日期： 少f 6年6月多日 日期：1忉旃／影日 万方数据 摘要摘要 摘要 摘要 隆头鱼科鱼类隶属于鲈形目，隆头鱼亚目，多栖息于近岸岩石或珊瑚间，体色艳 丽，多结集成群，以软体动物为食。中国产隆头鱼科鱼类有37属161余种。体型从 几厘米到几米不等，体态的多样性以及体态特征的隐蔽性给隆头鱼科物种鉴定带来了 很大的难度。因此，通过形态学和统计学来厘清隆头鱼科物种分类地位和起源非常困 难。本研究测定了隶属于隆头鱼科普提鱼属的尖头普提鱼线粒体全基因组序列，并分 析了其线粒体基因组特征，同时我们基于17种鱼类线粒体基因组序列利用贝叶斯推 断法构建了系统发育树，并结合松散分子钟推算了隆头鱼科鱼类的分化时间，期望能 为隆头鱼科分子研究积累分子数据。 主要研究结果如下： (1)本研究测定了隆头鱼科普提鱼属鱼类尖头普提鱼的线粒体基因组全序列，并 对其线粒体基因组进行结构特征分析。结果显示尖头普提鱼线粒体基因组碱基组成和 编码基因排列与多数脊椎动物一致，较为保守。基因之间存在间隔和重叠现象，除了 tRNA-Asn和tI讯A．Cys之间相隔35bp以外，其它基因间隔一般都在l～7bp之间。隆 头鱼科转运IⅢA基因(1If斟A)除tRNA．Scr(AGD基因缺少DHU臂结构，其余21个 tRNA都能够形成三叶草结构。检测到轻链复制起始区(OL)，并且能形成稳定的茎环 二级结构的，识别出臂结构保守序列5’．GCCGG．3’。通过序列比对在尖头普提鱼中检 测到终止序列结合区和CSB．1、CSB．2、CSB．3。 (2)结合从GenBaIlk数据库中获取的隆头鱼线粒体全基因组序列，分别分析了 16SrRNA、NDl、COI、Cytb和控制区(CR)的结构特征。结果显示它们的碱基组成都 具有高AT、低GC含量的特点：密码子第3位G碱基含量非常低，存在反G碱基偏 倚分布现象。 (3)基于17种线粒体全基因组序列运用贝叶斯法构建隆头鱼科分子系统发育树。 结果显示普提鱼属∞D妣，z切口力的尖头普提鱼先与拟隆头鱼属(丹例如肠6，．淞)的西氏拟 隆头鱼聚类到一起，并得到较高的后验概率支持，然后与白斑鹦哥鱼(册fD删舢 sD砌加)一起与海猪鱼属(Ⅳ口融D渊)黑尾海猪鱼聚成一枝，最后再与属于唇鱼属 (国Pf砌淞)的波纹唇鱼聚到一枝。这一结果能初步推断隆头鱼科普提鱼属和拟隆头鱼 属鱼类具有较近的亲缘关系。 (4)基于线粒体基因组36个编码基因序列采用松散分子钟估算结果表明，隆头鱼 I 万方数据 摘要科鱼类可能起源于始新世晚期至渐新世时段内，推测隆头鱼科鱼类是在寒冷的中新世 摘要 科鱼类可能起源于始新世晚期至渐新世时段内，推测隆头鱼科鱼类是在寒冷