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MS Sorption Copyright ©2010, Neotrident Technology Ltd. All rights reserved Copyright ©2010, Neotrident Technology Ltd. All rights reserved. 目录 Hands-on 练习：采用Sorption 模块预测CH 在沸石分子筛MFI 中的吸附 1 4 Hands-on 练习：预测离子在Al 取代的沸石分子筛MFI 中吸附位7 Hands-on 练习：采用Sorption 模块预测CH 在沸石分子筛MFI 中的吸附 4 练习目的：介绍如何使用sorption 计算分子在沸石分子筛内吸附的载荷曲线 使用模块：Materials Visualizer, sorption 练习时间：一课时 相关背景：Sorption 被用来模拟吸附物（客体分子）小分子在有孔的3D 多孔构架（主体分 子）中的吸附，这些框架主要是一些多孔的无机结构，如沸石类、磷酸铝类，这些材料的行 为特征在催化分离领域具有重要的应用价值。 Sorption 是为实验科学和计算化学设置的模块，输出分析特征，如自动计算和显示等温线， 使得与吸附数据直接比较更为容易。 本教程包括以下内容：  开始  设置计算参数  开始计算  分析结果 1. 开始 在打开MS 软件时，需要创建一个新的project 。 打开New Project 对话框，输入CH4_MFI 作为project 的名称, 然后点击OK 按钮。 一个新的名为CH4_MFI 的任务将会显示在任务工具栏中，下面将要输入需要的结构。 从菜单栏中选择File|Import... 点击Import 按钮打开Import Document 对话框，选择 Structures/organics 然后选择methane.msi，最后点击Open 按钮。 同理选择Structures/zeolites 然后选择 MFI.msi 点击 Open 按钮。 吸附计算要求P1 晶体结构 (没有对称性) ，因为客体分子的插入将会打破任意对称性。因此 需要将MFI 改为 P1 。 1 Copyright ©2010, Neotrident Technology Ltd. All rights reserved. 确保 MFI.xsd 是活性文件，选择 Build | Symmetry | Make P1。 2. 设置计算参数 下面需要设置计算参数。 点击Sorption 工具按钮 选择Calculation，将会打开Sorption Calculation 对话框。 Sorption Calculation 对话框，Setup 栏 选择Adsorption isotherm 作为Task 和 Metropolis 方法，设置 Quality 为Coarse。在 Sorbates 部分, 点击molecular 选择methane.xsd。 注意：Coarse 选项会使得这次计算很快，更好的统计结果需要设定为 Medium 或者 Fine 。 需要设置最高和最低的逸出压（fugacities ），计算将会在这个设定范围内以一定间隔来采点。 本例中采用了一个低的fugacity 为1 atm (101.325 kPa) 和一个高的fugacity 为10 atm (1013.25 kPa) 。 点击吸附物格子的第一个空白栏键入101.33 kPa 并在其后空白栏中键入1013 kPa。 点击 Task 的More...按钮，打开Sorption Isotherm 对话框。设置Fugacity 步数为9 并 选上 Logarithmic，温度保证为298 K，关闭对话框。 在 Energy 栏中选择 COMPASS 力场，设置Charges 为Forcefield assigned，设置Quality 为Medium，