昆明市售稻米指纹建立及其品质相关指标的PCR鉴定-作物遗传育种专业论文.docxVIP

英文缩略表 缩写 英文名称 中文名称 RFLP Restriction fragment length polymorphism 限制性片段长度多态 性 RAPD Random Amplified polymorphic DNA 随机扩增多态性 AFLP Amplified fragment length Polymorphism 扩增片段长度多态性 SNP Single nucleotide polymorphism 单核苷酸多态性 InDel Simple Sequence Repeat 简单序列重复 PIC Insertion/Deletion 插入/缺失 MI Marker Index 标记索引系数 PCA Principle coordinate analsys 主坐标分析 UPGMA Unweighted pair-group method with arithmetic average 算术平均非加权配组 法 GD Genetic Distance 遗传距离 AMOVA Analysis of molecular variance 分子方差分析 BADH Betaine Aldehyde Dehydrogenase 甜菜醛脱氢酶 目录 摘要 1 ABSTRACT 2 1 引言 4 1.1 水稻品种的真实性鉴定 4 1.1.1 种子形态鉴定 4 1.1.2 石炭酸染色鉴定 5 1.1.3 快速测定法 5 1.1.4 田间小区种植鉴定 5 1.1.5 培养生长箱测定法 5 1.1.6 蛋白质指纹技术鉴定 6 1.1.7 DNA 指纹技术 6 1.2 稻米品种的真实性鉴定研究 7 1.2.1 指纹图谱的研究进展 8 1.3 稻米相关品质性状的鉴定 11 1.3.1 稻米香味鉴定的研究 11 1.3.2 转基因稻米的成份鉴定的研究 12 1.4 本研究的目的和意义 14 2 材料与方法 15 2.1 供试材料 15 2.2 方法 16 2.2.1 稻米基因组 DNA 的提取 16 2.2.2 分子标记的 PCR 反应体系 17 2.2.3 SSR 和 InDel 标记反应程序 17 2.2.4 稻米转基因成份和香味分子检测的 PCR 反应程序 17 2.2.5 电泳分析检测 18 2.2.6 数据统计分析 18 3 结果与分析 19 3.1 昆明市售稻米品种 PCR 标记的多样性分析 19 3.1.1 稻米品种的 PCR 扩增 19 InDel 和 SSR 标记多态性比较 20 3.1.3 不同地理来源稻米品种的 PCR 标记多样性分析 22 3.1.4 各类群间稻米材料的 PCR 遗传多样性分析 24 3.1.5 类群内 PCR 产物的多样性分析 29 3.1.6 缅甸泰国与国内稻米材料之间的关系 32 3.2 昆明市售稻米 PCR 指纹图谱的构建 33 3.3 市售稻米的转基因成份的分子检测 37 3.3.1 稻米转基因成份 PCR 检测体系的建立 37 3.3.2 供试稻米材料是否为转基因品种的分子检测 38 3.4 市售稻米香味的分子鉴定 39 3.4.1 咀嚼法鉴定 39 3.4.2 分子鉴定 39 4 讨论 39 4.1 市售稻米的 PCR 分析 39 4.2 INDEL 和 SSR 标记的遗传多样性比较 40 4.3 市售稻米的聚类分析 41 4.4 遗传距离在稻米品种指纹图谱构建中的应用 41 4.5 市售稻米的 DNA 指纹图谱 42 4.6 市售稻米的转基因成份检测 42 4.7 市售稻米香味的鉴定 42 5 结论 43 参考文献 44 致谢 48 论文版权申明 49 昆明市售稻米品种指纹建立及其品质相关指标的 PCR 鉴定 PAGE PAGE 10 摘要 为揭示昆明市售稻米品种的真实性及其品质相关指标，本文利用SSR和InDel分子标 记技术构建了主要昆明市售稻米的DNA指纹图谱，并进行了遗传多样性和基因型聚类分 析，用与香味基因紧密连锁的标记对稻米进行了香味的分子鉴定，并采用咀嚼法加以佐 证，最后对供试材料进行了针对CaMV35S启动子、NOS终止子和潮霉素抗性标记序列等 转基