杨树基因敲除库的构建-南京林业大学招标办公室.docVIP

PAGE 6 PAGE 8 南 京 林 业 大 学 仪器设备采购招标文件 申请编号： NLZB2017211 招标项目名称：山新杨基因组三代测序及分析、杨树基因敲除库的构建、高压灭菌锅、离心机、热成像仪采购 南京林业大学招标办公室 2017年11月8日 目 录 TOC \o 1-3 \h \z \u 供应商须知表 3 招标文件 4 一、采购范围 4 二、采购数量及主要技术参数及要求 （下划线或星号为核心指标要求） 4 三、评标办法 8 四、付款方式 9 五、响应说明 9 六、投标响应文件 10 （一） 供货一览表（分包___） 10 （二）响应报价表 分包____ 11 （三） 技术参数响应与偏离表 12 （四） 服务承诺、培训承诺 12 （五） 资格证明文件（按照谈判文件第五款） 13 格式1 工商营业执照 13 格式2 法定代表人授权书 13 附件：合同格式 14 供应商须知表 序号 内 容 1 项目名称：仪器设备采购 标书编号：NLZB2017211 2 招标组织人：招标办公室招标组织人地址：南京市龙蟠路159号南京林业大学行政4号楼（老招待所）一楼招标会议室 3 招标文件售价：人民币壹佰元整/份，现金支付。文件售后一概不退。 4 投标保证金金额为人民币：叁仟元整； 开票信息： 单位名称：南京林业大学统一社会信用代码：12320000466006885L税?号：320102466006885地?址：江苏省南京市龙蟠路159号联系电话：02585428952开户银行：中国建设银行南京市城东支行开户账号：32001597336050000659行号：105301000894 招标采购所需交纳保证金的交纳形式为有效银行本票（同城）、银行汇票（异地）或现金。建议在开标现场交纳现金作为保证金。否则，由此给供应商造成的后果自负。 保证金有效期：投标保证金应在投标有效期截止日后五天内保持有效。如成交则在货物交付后无利息退回，如未成交，则在招标结束后无利息退回。 5 投标文件递交至：南京市龙蟠路159号南京林业大学行政4号楼（老招待所）一楼招标会议室 递交投标文件时间：2017年11月16日 下午2：00-2：30 投标文件接收人：招标办公室负责人（在现场收） 6 投标文件正本份数：1份 投标文件副本份数：2份 7 招标日期：2017年11月16日 下午2：30 招标地点：南京市龙蟠路159号南京林业大学行政4号楼（老招待所）一楼招标会议室 8 签订合同地点：南京林业大学实验室与基地建设管理处（老图书馆114室） 9 交货地点：按买方要求（学校内） 10 交货时间：以合同为准 招标文件 一、采购范围 本次采购范围包括： 仪器设备采购： 包号 仪器设备名称 数量（台/套） 1 山新杨基因组三代测序及分析 1 2 杨树基因敲除库的构建 1 3 高压灭菌锅 1 4 离心机 1 5 热成像仪 1 设备的现场安装、调试、线路施工及人员常用操作的现场培训。 投标企业所提供的货物应为完整全7新的设备，功能符合该设备的要求，或同档次、高于本谈判文件中的品牌档次的产品，货物必须符合国家有关标准。 （下划线或星号为核心指标要求） 二、采购数量及主要技术参数及要求 （下划线或星号为核心指标要求） 包1、 PacBio RSII测序及分析 1 套 一、三代基因组测序：使用PacBio RSII平台进行测序，完成测序量达到40 Gb（clean data）；测序N50读长12kb以上； 二、基因组拼接：对测序数据进行基因组拼接，contig N50达到Mb级别（与模式物种基因组共线性评价其拼接质量）； 三、生物信息学分析： 1. 重复序列(LTR_FINDER、RepeatScout、Piler、RepeatModeler，TRF)，RepeatMasker的默认为Repbase库，RepeatProteinMask分别在蛋白质和核苷酸水平分别对基因组重复序列进行Mask，然后进行基因注释； 2. 对四个杨柳科基因组进行基因预测、功能注释及ncRNA 注释；（同源注释：拟南芥、毛果杨、番木瓜、葡萄、蓖麻、水稻TblastN，再用Genewise预测；Denovo 采用August、Genescan等最少两个软件进行预测；RNA，PASA分析，最后用EVM整合）功能注释：KEGG、Swissprot、Interproscan、GO、Trembl； 3. 对四个基因组进行共线性分析和变异检测； 4. 比较基因组分析及进化分析 （1） 基因家族聚类及特有、