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Roche 最新推出多重基因表达芯片 Roche NimbleGen 最近推出了适用于 HD2 平台的 NimbleGen 基因表达 12×135K 芯片。这个 12 重芯片为全基因组基因表达图谱提供了高通量且经济划算的方案：在一张芯片上可以同时分析 12 个独立的样品。每张芯片上有 135,000 个长的寡核苷酸探针，能实现完整的转录本覆盖。与 NimbleGen 的 385K 和 4×72K 芯片相似，新的 12×135K 芯片显示了高特异性、高灵敏度和极佳的 重复性。目前有 8 种真核目录设计（人、小鼠、大鼠、拟南芥、线虫、果蝇、酿酒酵母和裂殖酵母）， 都是基于最流行的全基因组结构。如果研究者对最近测序或注释的基因组感兴趣，Roche NimbleGen 也可以提供定制设计。 美国印第安纳大学基因组学和生物信息 方法来搭建基因和基因功能之间的桥梁。她很 学中心的基因组学主管John Colbourne 一直 欣赏12×135K 芯片的功能性和数据的轻松判 使用HD2 12×135K 芯片来研究淡水小型甲 读。她说：“芯片杂交操作相对简单，而数据 壳动物水蚤群体如何对环境压力做出反应。他 分析也很容易掌握，不需要很专业的信息学技 们应用NimbleGen 表达芯片来验证目前的基 能。” 因列表，并完善基因结构模型。他们认为实验 NimbleGen 的芯片技术已经使用在无数 结果更好地描绘出基因组的转录区域。由于每 的应用中，例如研究组织和细胞中与多个信号 一个12 重芯片能容纳135,000 个探针， 通路相关的基因表达水平。研究人员已经利用 Colbourne 的研究小组为每个预测的基因设 了这个系统的灵活性来鉴定组织分化中的因 计出三个探针，每个转录区一个探针。 子，并评估亲缘关系相近的物种的基因分化表 Colbourne 表示：“大约有40% 的探针位于未 达模式。后续的潜在应用还包括癌症和干细胞 注释的区域。而没有其他的芯片能轻松承担这 研究中的基因表达研究、细胞分化、药物试验、 种‘奢侈’。我们的转录图谱实验很快检测到了 环境研究和食品检测。 所有鉴定基因以及许多未知基因在一系列环 境中的共调控，同时也改善了基因组注释。” Roche NimbleGen 的总裁兼CEO Gerd Maass 表示：“12×135K 芯片是实现高通量基 灵活的定制设计和基因表达数据的卓越 因表达图谱的强大工具。将NimbleGen 定制 品质使12×135K 芯片脱颖而出。这种多重形 设计和高探针密度结合起来，这些芯片可以方 式更经济划算，同时也不会损害数据质量。康 便准确地分析大量物种，从最简单的细菌到复 奈尔大学医学院的副教授Licia Selleri 就证实 杂的哺乳动物和植物。这些芯片将加速功能基 “NimbleGen 的12 重基因表达芯片的使用是 因组学研究，为我们的目标提供创新的解决方 有优势的，且比其他平台更准确，因为它能在