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理论跟系统生物学概论资料精
理论与系统生物学概论
上课时间
周二3-4节,理教112;
周三7-8节,二教106(双周)
考试方式 :考试方式为课堂作业与平时表现(20%) ;
+ 期末论文口头与书面报告(80%)
课程目的 :介绍本专业所涉及的基本知识和基本技能,主要研究方
向和应用背景,当前的热点问题和今后的发展方向。同时使学生了解
数理学科中研究理论与系统生物学问题的重要研究方法和解决该类方
面问题的基本思路。使研究生对本领域的研究工作有较全面的了解,
并为他们提供一个相互交流、相互促进的学习机会。
理论与系统生物学概论
9月11日 理论与系统生物学的现状与展望(来鲁华)
9月18日,21日,蛋白质折叠与结构预测(来鲁华)
9月25日,蛋白质折叠与结构预测(来鲁华)
10月9日 蛋白质动力学与相互作用研究(刘志荣)
10月16日,19日,蛋白质动力学与相互作用研究(刘志荣)
10月23日,生物网络研究与相关非线性物理方法(欧阳颀)
10月30日,11月2日,生物网络研究与相关非线性物理方法
11月6日,生物网络研究与相关非线性物理方法
11月13日,16日,药物设计方法(裴剑锋)
11月20日,常用计算方法(邓明华)
11月27日,30日,常用计算方法(邓明华)
12月4日,常用计算方法(邓明华)
12月11日,14日,前沿讲座(汤超)
12月18日,基因组序列与结构分析(朱怀球)
12月25日,28日,基因组序列与结构分析(朱怀球)
人类基因组
• 三万个基因
• 十万个蛋白质 预测功能 未知功能
40 %
• 60%的基因功 60 %
能不清楚
• 只有不到10%经
过实验验证
确定基因功能及其调控机制是后基因组时代的主要任务
Beyond the Genome — Functional Genomics
Beyond the Genome — Functional Genomics
•
•
Integration of Functional Maps
from Cell, 2001. 104:333-339
二十一世纪是生命科学走向定量化的世纪:
• 生物学积累了大量的数据,飞速增长的数据积累为生命科学的质的飞
跃提供了实验基础;
• 生物学的研究开始从对单一基因、蛋白的定性描述转移到对复杂蛋白
与基因调控网络的定量刻画。
Nature Biotechnology 22, 1253 - 1259 (2004), Systems biology in drug discovery
Eugene C Butcher, Ellen L Berg Eric J Kunkel
Lifes Complexity Pyramid
(from Oltvai-Barabasi, Science, Oct 02)
if you start from complex,
multivariate data, its more
difficult to formulate
hypotheses than it used to be.
There is an aspect of discovery
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