沙鼠属三个近缘种线粒体D-loop高变区序列比较分析.pdfVIP

摘 要 摘 要 子午沙鼠、长爪沙鼠和郑氏沙鼠属于沙鼠属的三个近缘种，子午沙鼠和长爪 沙鼠分布区广泛，因此，它们可以作为研究蒙新区小型哺乳动物系统地理学比较 理想的研究对象, 本研究通过对子午沙鼠和长爪沙鼠线粒体控制区高变序列的 种群遗传变异地理分布格局分析，试图探讨第四纪冰期及青藏高原近代的隆升等 地质事件对我国蒙新区小型哺乳动物地理分布格局形成及进化的影响。 动物线粒体是一种存在于真核生物细胞质中的细胞器,可编码13种蛋白质,2 种rRNA, 22种tRNA和非编码区 (D-Loop)。D-Loop高变区序列，呈现母性遗传特点， 在种间甚至种内存在着差异，因此可作为动物特异的分子标记。 本文通过测定来自这三个近缘种 127 个样品线粒体控制区高变序列 398bp， 共定义 78 个单倍型，其中 4 个为郑氏沙鼠和子午沙鼠的共享单倍型，其它为特 有单倍型。序列经比对后，共发现有 136 个变异位点 （占全序列的34.2%），其 中 5 个插入/缺失位点，79 个转换位点，35 个颠换位点，17 个既发生了转换又 发生了颠换的位点。 三个近缘种中，子午沙鼠的核苷酸多样性最高，长爪沙鼠核苷酸多样性最低； 子午沙鼠的单倍型多样性最高,郑氏沙鼠的单倍型多样性最低。基于单倍型构建 NJ 系统树显示，三个种共形成两大支系，其中郑氏沙鼠和子午沙鼠的各个支系 聚成一个大支，另外长爪沙鼠独立聚为一支。子午沙鼠形成了明显的系统地理格 局,系统树聚成三个支系对应其地理分布文中将它分成了三个地理种群,即东南 种群,天山种群和西北种群，郑氏沙鼠的四个单倍型分散点缀在东南种群的支系 中。分子变异分析（AMOVA ）表明，物种间的遗传变异占 88.25%，物种内的遗 传变异占 11.75%。FST 统计结果表明，地理种群间的差异均极显著(P0.01) 。通 过遗传距离计算的三种沙鼠的分歧时间大约在 0.064 Ma 前（子午沙鼠和郑氏沙 鼠）、0.72 Ma 前（子午沙鼠和长爪沙鼠）、 0.74Ma 前（长爪沙鼠和郑氏沙鼠）。 通过地理种群间的核苷酸歧异度计算子午沙鼠三个地理种群的分化时间大约 0.39-0.57Ma 前，该遗传分化发生在中更新世期间（750-125Ka）和晚更新世 （125-10Ka）时期，最可能的原因就是第四级冰川的影响和地理障碍的阻隔。 子午沙鼠（全部和各个地理种群）和长爪沙鼠个体间的歧点分布呈单峰状， I 沙鼠属三个近缘种线粒体 D-loop 高变区序列比较研究 并且两种沙鼠的Fu检验值都是负值，提示子午沙鼠和长爪沙鼠可能都经历种群增 长和扩张事件，该扩张时间分别大约发生在47和31Ka前，可能受到末次冰期波动 的影响。 关键词 mtDNAD-Loop 高变区 子午沙鼠 长爪沙鼠 郑氏沙鼠 II 摘 要 Abstract M. meridianus, M. chengi and M. unguiculatus are three closely related species in the meridianus species group. M. meridianus, M. unguiculatus is wide-spread specie. M. chengi are restricted to the city of TuLuFan. The mitochondrion of animals is a organelle appearing in cytoplam of eukaryotes. It contains genes encoding 13 proteins, 2rRNAs, 22tRNAs and one major noncoding region(D-Loop). The varied region of D-Loop, with the characteristics of maternal inheritance,