生物信息实验报告4(四)多序列分析及系统进化树构建.docVIP

生物信息实验报告4(四)多序列分析及系统进化树构建.doc

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(四)多序列分析及系统进化树构建 实验目的:掌握多序列比对、构建系统进化树的基本步骤,熟悉使用CLUSTALW、MEGA5.1等软件的使用。 实验内容: 1、利用CLUSTALW工具进行多序列比对,学会参数设置,结果输出。将本实验室获得的仿刺参EGFR基因氨基酸序列,搜索同源序列,保存序列进行比对。 2、利用MEGA5.1构建系统进化树,并用自展分析对进化树进行评估。 实验步骤: 1、将仿刺参EGFR基因氨基酸序列使用在线NCBI工具,进行Blast同源性比较见表1。 NCBI上做Blast /blast/Blast.cgi 找到相似度最高的几个序列,通常把序列(Fasta格式文件)下载下

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