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(四)多序列分析及系统进化树构建
实验目的:掌握多序列比对、构建系统进化树的基本步骤,熟悉使用CLUSTALW、MEGA5.1等软件的使用。
实验内容:
1、利用CLUSTALW工具进行多序列比对,学会参数设置,结果输出。将本实验室获得的仿刺参EGFR基因氨基酸序列,搜索同源序列,保存序列进行比对。
2、利用MEGA5.1构建系统进化树,并用自展分析对进化树进行评估。
实验步骤:
1、将仿刺参EGFR基因氨基酸序列使用在线NCBI工具,进行Blast同源性比较见表1。
NCBI上做Blast
/blast/Blast.cgi
找到相似度最高的几个序列,通常把序列(Fasta格式文件)下载下
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