藏鸡POU1F1基因的克隆测序及生物信息学分析.pdf

２０１８年７ 月 西南民族大学学报(自然科学版) Ｊｕｌ２０１８ 第４４卷第４期 Ｊｏｕｒｎａｌ ｏｆ Ｓｏｕｔｈｗｅｓｔ Ｍｉｎｚｕ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ (Ｎａｔｕｒａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅ Ｅｄｉｔｉｏｎ) Ｖｏｌ４４ Ｎｏ４ 第４ 期 徐亚欧ꎬ等:藏鸡ＰＯＵ１Ｆ１基因的克隆测序及生物信息学分析 　　　　　 ｄｏｉ:１０１１９２０/ ｘｎｍｄｚｋ２０１８０４００１ 藏鸡ＰＯＵ１Ｆ１基因的克隆测序及生物信息学分析 １ １ ２ ２ １ 徐亚欧 ꎬ梅　 寒 ꎬ徐珑洋 ꎬ王志敏 ꎬ王英明 (１ 西南民族大学生命科学与技术学院ꎬ四川　 成都　 ６１００４１ꎻ２ 西南民族大学青藏高原研究院ꎬ四川　 成都　 ６１００４１) 摘　 要:为研究青藏高原特有鸡种ꎬ藏鸡的生物学特性ꎬ从藏鸡垂体组织的ＲＮＡ 中克隆ＰＯＵ１Ｆ１基因ꎬ并利用生物信息 学对其进行分析.结果显示ꎬ藏鸡ＰＯＵ１Ｆ１基因开放阅读框(ＯＲＦ)长为９８４ｂｐꎬ编码３２７ 个氨基酸.编码序列中有１３ 个 丝氨酸(Ｓｅｒ)、２ 个酪氨酸(Ｔｙｒ)、６ 个苏氨酸(Ｔｈｒ)磷酸化位点ꎻ１个Ｎ糖基化位点ꎻ二级结构主要由α￣螺旋和无规则卷 曲构成ꎻ藏鸡ＰＯＵ１Ｆ１氨基酸序列与红色原鸡ＰＯＵ１Ｆ１氨基酸序列的亲缘关系最近.藏鸡ＰＯＵ１Ｆ１基因氨基酸序列可 能与藏鸡生长速度慢的特性相关.这一研究结果为今后的藏鸡育种工作提供重要的靶点和参考. 关键词:藏鸡ꎻＰＯＵ１Ｆ１基因ꎻ生物信息学分析 中图分类号:Ｑ７５ꎻＳ８３１２　 　 　 　 　 　 　 　 文献标志码:Ａ　 　 　 　 　 　 　 　 　 文章编号:２０９５￣４２７１(２０１８)０４￣０３３１￣０７ Ｃｌｏｎｉｎｇꎬｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ ａｎｄ ｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓ ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆＰＯＵ１Ｆ１ｇｅｎｅ ｏｆ Ｔｉｂｅｔａｎ ｃｈｉｃｋｅｎ １ １ ２ ２ １ ＸＵ Ｙａ￣ｏｕ ꎬＭＥＩ Ｈａｎ ꎬＸＵ Ｌｏｎｇ￣ｙａｎｇ ꎬＷＡＮＧ Ｚｈｉ￣ｍｉｎ ꎬＷＡＮＧ Ｙｉｎｇ￣ｍｉｎｇ (１Ｓｃｈｏｏｌ ｏｆ Ｌｉｆｅ Ｓｃｉｅｎｃｅ ａｎｄ ＴｅｃｈｎｏｌｏｇｙꎬＳｏｕｔｈｗｅｓｔ Ｍｉｎｚｕ ＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙꎬＣｈｅｎｇｄｕ６１００４１ꎬＰＲＣ ꎻ ２Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅ ｏｆ Ｑｉｎｇｈａｉ￣Ｔｉｂｅｔ ＰｌａｔｅａｕꎬＳｏｕｔｈｗｅｓｔ Ｍｉｎｚｕ ＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙꎬＣｈｅｎｇｄｕ６１００４１ꎬＰＲＣ ) Ａｂｓｔｒａｃｔ:Ｉｎ ｏｒｄｅｒ ｔｏ ｓｔｕｄｙ ｔｈｅ ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌ ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｓｔｉｃｓ ｏｆ Ｔｉｂｅｔａｎ ｃｈｉｃｋｅｎ ｓｐｅｃｉｅｓ ｏｎ ｔｈｅ Ｑｉｎｇｈａｉ￣Ｔｉｂｅｔ Ｐｌａｔｅａｕꎬｔｈｉｓ ｓｔｕｄｙ ｃｌｏｎｅｄ ｔｈｅＰＯＵ１Ｆ１ｇｅｎｅｆｒｏｍ ｔｈｅ ＲＮＡ ｏｆ ｔｈｅ ｐｉｔｕｉｔａｒｙ ｔｉｓｓｕｅ ａｎｄ ａｎａｌｙｚｅｄ ｉｔ ｂｙ ｕｓｉｎｇ ｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓ.Ｔｈｅ ｒｅｓｕｌｔｓ ｓｈｏｗｅｄ ｔｈａｔ ＰＯＵ１Ｆ１ｇｅｎｅ ＯＲＦｗａｓ９８４ｂｐꎬｅｎｃｏｄｉｎｇ３２７ ａｍｉｎｏ ａｃｉｄｓＴｈｅｒｅｗｅｒｅ １３ ｓｅｒｉｎｅ(Ｓｅｒ)ꎬ２ ｔｙｒｏｓｉｎｅ (Ｔｙｒ) ａｎｄ６ ｔｈｒｅｏｎｉｎｅ(Ｔｈｒ) ｐｈｏｓｐｈｏｒｙｌａｔｉｏｎ ｓｉｔｅｓ