核酸的分离与纯化27052.pptVIP

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核酸的分离与纯化 基本知识回顾 核酸(nucleic acid):以核苷酸为基本组成单位 的生物信息大分子 具有复杂的结构 DNA 重要的功能 天然存在的核酸 信息的载体 RNA 信息的储存、传递与表达 基本知识回顾 DNP-脱氧核糖核蛋白 RNP-核糖核蛋白 真核生物-染色体DNA和细胞器DNA 原核生物-双链环装质粒DNA 基本知识回顾 第一节 核酸分离与纯化的设计与原则 DNA 组成: 染色体DNA、细胞器DNA、质粒DNA。 分子总长随生物进化程度而增长 RNA 分子比DNA分子要小的多。 功能多样性 种类、大小、结构都具多样性 一、材料与方法的选择 材料与方法的选择 临床标本繁多:血液、尿液、唾液、组织及培养细胞等 不同的研究目的对核酸的完整性、产量、纯度和浓度可能有不同的要求,还需考虑制备核酸所需的时间与成本,在不影响核酸质量的情况下,应选择完全无毒的试剂与方案。 选择原则 一是保证核酸一级结构的完整性 二是尽量排队其它分子的污染,保证样品的纯度。 保持核酸的完整性 首先,应尽量避免各种有害因素对核酸的破坏(pH,高温) 其次,对无法避免的有害因素,应采取多种措施,尽量减轻各种有害因素对核酸的破坏(提取时间、DNA酶、RNA酶等)。 二、技术路线的设计 核酸的释放 DNA与RNA均位于细胞内,因此核酸分离与纯化的第一步就是破碎细胞、释放核酸。 机械法 液体剪切法 细胞的破碎方法 固体剪切法 非机械法 干燥法 溶胞法 二、技术路线的设计 续 核酸的分离与纯化: 利用核酸与其它物质在一个或多个性质上的差异设计有效方案,才能使核酸得以分离。 细胞定位与组织分布上的差异 核酸与其它物质的差异: 物理化学性质上的不同 各自独特的生物学特性 二、技术路线的设计 续 核酸的浓缩、沉淀与洗涤 核酸提取试剂的逐步加入,以及去除污染物过程中核酸分子不可避免的丢 失,样品中核酸的浓度会下降 三、鉴定与保存 核酸的鉴定 1.浓度鉴定:可通过紫外分光光度法与荧光光度法进行。 紫外分光光度法: 原理:核酸分子成分中的碱基具有一定的紫外线吸收特性。核酸的最大吸收波长为260nm,溶液中核酸的浓度与溶液在260nm紫外线下的吸光度(修正参数:A260-A310)成正比。 灵敏度:0.25ug/ml 荧光光度法: 原理:核酸的荧光染料溴化乙锭(EB)嵌入碱基平面后,使本身无荧光的核酸在紫外线激发下发出检红色的荧光,且荧光强度积分与核酸含量呈正比。 灵敏度:1-5ng 三、鉴定与保存 2.纯度鉴定: 紫外分光光度法 DNA:在TE缓冲液中,纯DNA的A260/A280比值为1.8 蛋白质(280nm)与酚(270nm)使比值下降 RNA(260nm)使比值升高 RNA:在TE缓冲液中,纯RNA的A260/A280比值为2.0,但由于RNA二级 结构不同,其读数可能在1.8-2.1之间波动。 鉴定RNA纯度所用溶液的pH会影响A260/A280读数。 三、鉴定与保存 2.纯度鉴定: 荧光光度法 用EB示踪,进行核酸电泳: DNA分子电泳迁移率低; 总RNA(三条带): 23S rRNA 28S rR

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