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分类号___________ 密级____________
UDC _____________ 编号____________
中国科学院生物物理研究所
博士后研究工作报告
肿瘤抑制相关蛋白RBBP1 各结构域的结构与功能研究
宫维斌
工作完成日期 2009 年 10 月——2011 年 11 月
报告提交日期 2011年 11 月
中国科学院生物物理研究所(北京)
2011 年 11 月
题名页范例
肿瘤抑制相关蛋白RBBP1 各结构域的结构与功能研究
Structural and functional studies of the domains of a tumor suppression relative protein, RBBP1
博士后姓名 宫维斌
流动站(一级学科)名称 生物学
专业(二级学科) 名称 生物物理
研究工作起始时间 2009 年 10 月 28 日
研究工作期满时间 2011 年 11 月 10 日
中国科学院生物物理研究所
2011 年 11 月
中文摘要范例
内容摘要
RBBP1 蛋白与RB 家族蛋白特异性相互作用,抑制细胞增殖相关基因的转录和表达。此外,RBBP1 与其同源蛋白RBBP1L1 也参与表观遗传学调控,并抑制乳腺癌、白血病等疾病。因此,对RBBP1 的研究具有重要的生物学意义和潜在的医药应用前景。本文对RBBP1进行了一系列的结构和功能的研究。
RBBP1 蛋白包含TD、PD(结构已得到解析)、AD、CD 和R2D 等5个结构域,。本文通过分子生物学方法和核磁共振方法发现:R2D 结构域不可溶;AD 结构域可溶不稳定;TD、PD 和CD 结构域可以得到较高浓度的蛋白样品,并且它们皆可以独立折叠,彼此之间没有相互作用。
TD,PD 和CD 结构域都属于“royal family”家族,该家族主要结合赖氨酸和精氨酸甲基化的组蛋白。本文发现,RBBP1 TD 和PD 结构域不结合Lys-me1, Lys-me2, Lys-me3 以及Arg-me2也不识别H3K9me3, H3K27me3, H3K36me3 和H4K20me3 等甲基化组蛋白。而CD 结构域结合上述各底物,并且对H4K20me3 具有最强亲和力。因此,CD 结构域是RBBP1识别甲基化组蛋白的关键结构域。我们进一步解析了CD 结构域的结构,并通过点突变研究确认了其活性位点残基。CD 结构域具有典型的chromobarrel 结构,并形成了该结构域中保守的芳环盒子,可识别甲基化组蛋白。
我们也解析了TD 结构域的结构,发现这是一个少见的交叉双Tudor结构,与组蛋白去甲基化酶JMJD2A 的双Tudor 结构类似,而它们的序列同源性低,且具有不同的功能。
关键词:肿瘤抑制相关蛋白,蛋白质结构,核磁共振,蛋白质-蛋白质相互作用,甲基化组蛋白
英文摘要范例
Abstract
RBBP1 specifically interacts with RB protein family, suppressing transcription and expression of cell-growing related genes. Moreover, RBBP1 and its homology protein RBBP1L1 also attend epigenetic regulation and function as leukemia and tumor suppressor. Since they are biologically important, we performed a series of structural and functional studies with RBBP1, which will help future medical studies.
RBBP1 protein has 5 domains, including TD, PD (structure resolved), AD, CD and R2D. In this study, we found that R2D domain is insoluble and AD domain is soluble but not stable. The TD, PD and CD domains are soluble and stable at high concentration. These three d
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