医学数据挖掘 第四章 网络分析 1.ppt

疾病基因与药物靶点距离 案例：利用cytoscape软件分析癌症基因网络的拓扑属性 获得癌症基因互作网络 将网络导入到cytocape网络可视化分析软件中 选择plugins-Network analysis-analyze network Cytoscape： 网络的拓扑分析： 选择analyze Network 计算节点的度： 选择calculateNodeDegree 二、无标度网络 无标度网络定义 是指网络中连通度的分布符合幂率分布，即P(k)~k-r的网络 A为随机网络，其连通度分布符合泊松分布，在大尺度情况下近似服从正态分布。 B为无标度网络，其连通度分布符合幂率分布，平均聚类系数函数曲线水平 C为层次网络，其连通度分布与符合幂率分布，平均聚类系数与连通度的倒数成正比 癌症基因网络的度分布 无标度网络形成的生物模型 三、生物分子网络的模块性 网络中由许多分子相互结合形成的，有着稳定结构和功能的复合体，称为网络“模块”(module)。 网络的模块性指网络间的节点存在着内部彼此高度连接的子节点集合。由此，模块化的网络连通更为紧密。 类似概念：模块（module）：簇（cluster）；社区（community）；子图（subgraph） 连通组分（connected components）模块 计算图