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- 2019-07-13 发布于湖北
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应用16S rRNA基因序列分析技术鉴定临床非典型细菌
王艳萍 , 夏云
(重庆医科大学附属第一医院检验科, 重庆 400016)
【摘 要】目的:将16S rRNA基因序列分析技术应用于微生物实验室传统方法鉴定可靠率低或无法鉴定的细菌,以提高临床诊断的准确性。方法:以我院微生物实验室保存的5株标准菌株验证实验方法的准确性后,收集实验室常规方法不能鉴定或鉴定可靠性低的临床分离菌15株(涵盖革兰阳性球菌,革兰阳性杆菌及革兰阴性杆菌),提取DNA模板,通用引物 PCR 扩增16S rRNA目的片段后测序,将测序结果在 GenBank数据库中比对分析后确定菌种。结果:在15株实验细菌中,有14株菌(93.3%)成功鉴定到种的水平,包括鼻疽诺卡菌,大肠埃希菌,阿尔莱特葡萄球菌,脆弱拟杆菌,弗氏柠檬酸杆菌,短小芽孢杆菌,河流漫游球菌,极小短小杆菌,伴放线凝聚杆菌,毗邻颗粒球菌;1株菌鉴定到属的水平,归属于短状杆菌属。结论:16S rRNA基因序列分析技术鉴定细菌具有准确、快速及简便的特点,适用于临床非典型菌、少见菌以及新型细菌的鉴定,可作为细菌常规鉴定手段的必要补充。
【关键词】16S rRNA;核糖体;细菌;鉴定
Identification of clinical atypical bacteria by 16s rRNA gene sequence analysis
WANG
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