糖合成酶与糖基转移酶的挖掘.doc

PAGE 1 目 录 TOC \o 1-3 \h \z \u 引言 1 1 糖合成酶与糖基转移酶的挖掘 2 2 揭示了代谢网络组织的化学基础 2 3 构建了信息导向生物合成途径设计平台 3 4 结论 5 参 考 文 献 6 附 录A 本年度发表论文情况 7 附录B 申请专利与软件著作权 8 插图清单 TOC \c 图 图 1 糖合成酶与糖基转移酶的挖掘 2 图 2 根据代谢物化学性质和网络结构预测代谢物浓度的理论模型 3 图 3 RxnIP中的逆向生物合成反应途径设计 4 附表清单 引言 微生物药物是人类健康的卫士，其产业早已成为我国生物医药产业的支柱。然而，由于我国微生物药物产业多以原料药和仿制药为主，且存在着产率低下和排污量大的缺点，长期以来对社会、经济和环境所产生的压力和不利影响与日俱增。………………………………………… 糖合成酶与糖基转移酶的挖掘 糖基化修饰对微生物药物、代谢产物的生物活性具有重要影响，糖类化合物是微生物药物人工合成体系中的关键元件。 图 SEQ 图 \* ARABIC 1 糖合成酶与糖基转移酶的挖掘 揭示了代谢网络组织的化学基础 系统生物学研究揭示，三界生命在代谢网络组织方面呈现共同的无标度特征。该特征对维持生物网络的稳定性有重要意义，但一直缺乏合理的解释。本课题组综合使用化学信息学与生物信息学方法，发现生命的代谢网络组织有很强的化学基础。 图 SEQ 图 \* ARABIC 2 根据代谢物化学性质和网络结构预测代谢物浓度的理论模型 构建了信息导向生物合成途径设计平台 重组了具有化学转化意义和基于代谢途径的基因组规模代谢网络，目前有效整合了超过20,000多条的生物合成反应数据，开发了对外开放数据库(/rxndb)。开发了快速和准确搜索生物合成反应的信息化平台 (/rxnfinder/)。初步实现了生物合成反应关键反应模式提取的技术 (/rxnpattern/rxnpatter）；初步在google和chrome浏览器中实现了在三维空间中显示生物合成信息的技术(/ModMet3D），为开展信息导向的生物合成途径搜索和设计奠定了坚实的基础。 图 SEQ 图 \* ARABIC 3 RxnIP中的逆向生物合成反应途径设计 结论 在项目执行的第一年，各课题集中于各自原有的研究体系，已建立了微生物药物创新与优产研究相关的技术方法，培养了一支创新能力强的人才队伍，圆满完成阶段性研究目标，取得预期成果。但仍存在研究对象和体系偏多、课题间的合作交叉仍需加强等问题。 参 考 文 献 附 录A 本年度发表论文情况 编号 类别① 作者 论文题目 杂志名称 年份 卷期 页码 是否责任作者② 作者单位③ 1 S Sun YM, Wang M, Wang Q, Cao BY, He X, Li K, Feng L, Wang L Genetic analysis of the Cronobacter sakazakii O4 to O7 O-antigen gene clusters and development of a PCR assay for identification of all C. sakazakii O serotypes Applied and Environmental Microbiology 2012 78 3966-74 是 南开大学（1） 2 S Liu B, Chen M1, Andrei V. Perepelov, Liu JF, Olga G. Ovchinnikova , Zhou DW, Feng L, Antoni Rozalski, Yuriy A. Knirel, Wang L Genetic analysis of the O-antigen of Providencia alcalifaciens O30 and biochemical characterization of a formyltransferase involved in the synthesis of a Qui4N derivative Glycobiology 2012 22 1236-44 是 南开大学（1） 附录B 申请专利与软件著作权 编号 发明名称 发明人 （排名）① 专利号 专利 申请日 专利权人 授权时间② 1 一种氧化葡萄糖酸杆菌（G.oxydans）的基因工程菌及其应用 林金萍（1） ZL 2009 1 0196972.1 2009.10.10 华东理工大学 2012.7.11 2 嗜热内切木聚糖酶基因工程菌的构建及其酶的应用 冯雁(1) 杨广宇(3) 申请号201110406838.7. 201