分子生物学2第二章--DNA结构.pptVIP

第二章 DNA的结构 第一节 遗传物质的本质 第二节 核酸的化学组成 第三节 DNA的二级结构 第四节 DNA的物理化学性质 第五节 超螺旋和拓扑异构 第一节 遗传物质的本质 第二节 核酸的化学组成 第二节 DNA的二级结构 第四节 DNA的物理、化学性质 基因组的复杂性＝单一序列的长度＋重复序列的长度 第五节 超螺旋和拓扑异构 dCt / dt = KC02 积分 Ct / C0 = 1 / (1+KC0t ) 当 Ct / C0 = 1/2 时 Ct / C0 = 1/2 = 1 / (1+ KC0t(1/2)) K = 1 / Cot(1/2) Cot(1/2) = 1/K (mol. Sec / L) 常数 Ct/C0是C0t的函数 按此公式作图得C0t曲线 Ct/C0 0 1 C0t(1/2) C0t 复杂性的单位为核苷酸的数目 例如：含单一序列a, b, c, d 复杂性＝a+b+c+d 复杂性＝分子量 含106a, 103b, 10c, d 复杂性＝a+b+c+d 复杂性＜＜分子量 ?基因组的复杂性(genomic complexity) 复杂性 * C0t和DNA的复杂性间存在线性关系： the more complex a DNA, the higher its Cot(1/2) 1 :10－6 2×105 :0.4 2×109 :4000 A typical mammalian C0t curve has three plateaus * C0t曲线能解释单一来源的DNA所具有的不同复杂性部分 真核生物的基因组由 高度重复（highly repetitive)序列、 中度重复（moderately repetitive or mid-repetitive) 序列 单一（single copy)序列组成 四、富含A－T序列和DNA双螺旋结构的呼吸作用 ●? 高等生物染色体的某一区段，A·T含量变化很大 很多有重要调节功能的的DNA区段都富含A·T （原核、真核－－ 复制起点、 启动子、终止子等区域） ●?? DNA双螺旋结构的呼吸作用：DNA双螺旋结构内部， 配对碱基的氢键的迅速断裂和再生的过程 ●?? DNA内富含A·T区段呼吸作用尤为明显 这对于某些特殊的蛋白质与DNA发生反应并阅读链 内部的信息具有重要作用 三、双螺旋结构的基本形式 · B-DNA 资料来自相对湿度为92％所得到的DNA钠盐纤维 · 此外人们还发现了A、C、D、E等右手双螺旋和左手双螺旋 Z构象等形式 DNA结构的多态性：几种不同的DNA双螺旋结构以及同 一种双螺旋结构内参数存在差异的现象 原因：多核苷酸链的骨架含有许多可转动的单键 磷酸二酯键的两个P-O键、糖苷键、戊糖环各个键 A B Z Handedness Base Inclination A B Z 大沟宽 小沟窄 小沟窄 大沟变深 小沟宽浅 大沟不存在 小沟窄而深 1、反向重复序列与二级结构 反向重复序列（inverted repeatitive sequence or inverted repeats IR） 又称回文序列（廻文）：指两段同样的核苷酸序列同时存 在于一个分子中，但具有相反的方向 有时也有不完全相同的情况 RNA和DNA中都可能存在 此外还可有directed repeatitive sequence ---正向重复序列 四、一些DNA序列的不寻常结构 C 反向重复序列间间隔较短或无间隔 反向重复序列间间隔较长 * 较短的回文序列可能是作为一种信号 如：限制性内切酶的识别位点 一些调控蛋白的识别位点 例如限制性内切酶 EcoRⅠ的识别位点 5‘－－GA