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第一章 简介
凝胶电泳是每个做分子生物学的研究者天天都要打交道的基本技术。电泳之后的信息处理与电泳本
身同样重要。 目前有大量软件可以用于分析电泳结果, 要向大家介绍的是 Bio-Rad 公司的 1D凝胶分析软件
Quantity One (Bio-Rad 还有一个做 2D 凝胶分析的软件 PDQuest)。 Quantity One 软件是常用 1D凝胶分
析软件中功能最强大,自动化程度最高的软件。这个软件的最新版本可以在 Bio-Rad 的网
( )免费下载,以供试用或用户升级之用。
Quantity One 软件的主要功能包括定量分析 (Volumes Quick Guide) ,电泳条带分析 (Band Analysis) ,
差显分析 (Differential Display Analysis) ,克隆计数 (Colony Counting Analysis) 等,此外,还可以直
接控制 Bio-Rad 公司的各类图像仪和 ExQuest 自动切胶仪,使您的凝胶分析工作变得极为轻松。
Quantity One 软件拥有与 windows 操作系统下绝大多数应用软件相同的友好界面。
插入密码狗,打开 Quantity One 软件,可以看到最上缘蓝色横条幅是标题栏,往下依次是菜单栏和
工具栏。
File 图像打开、保存、引入、打印 Ma 分子量估算、条带匹配分析
等操作 tch
Edit 图像普通编辑操作 Vo 定量分析
lumn
View 图像缩放、三维视图、看光密 An 浓度估算、克隆计数等分析
度值等操作 alysis
Imag 图像旋转、翻转、裁切等操作 Re 分析结果输出 每
e ports 个菜单
Lane 泳道分析 Wi 窗口分析 的主要
ndow 功能如
Band 条带分析 He 帮助、快捷菜单、软件注册 下:
lp 等
往
下一行是工具栏,上面每个按钮的功能见下表:
Quantity One 软件 Help àQuick Guide 快捷指南提示如何实现一个功能,如定量分析 (Volumes Quick
Guide) ,电泳条带分析 (Band Analysis) ,差显分析 (Differential Display Analysis) ,克隆计数 (Colony
Counting Analysis) 等。快捷指南下有 1,2,3 , 步骤,根据提示完成。
使用 Quantity One 软件进行电泳结果分析,通常包括图像获取、图像预处理、分析、结果输出四部
分。图像获取就是通过软件控制扫描仪 (GS-800、PharosFX 等)或凝胶成像系统 (GelDoc 、ChemiDoc、VersaDoc
等),图像预处理就是将扫描或拍照获得的原始图像进行初步处理,以便更好地进行后续分析。接下来是
分析过程,根据分析的方法和目的不同,又可以分为定量分析、条带分析、克隆计数、差异(聚类)分析
等等。不管如何分析,最终我们都
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