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第四章 基因与基因组的结构与功能 4.1 基因的概念 4.2 基因的命名 4.3 基因组 4.4 病毒与基因组 4.6 真核生物基因组 4.1 基因的概念 基因概念的发展 (一)遗传“因子”:孟德尔认为,生物性状的遗传由遗传因子所控制,性状本身不遗传。 (二)染色体是基因的载体:摩尔根实验证明基因位于染色体上,并呈直线排列,提出了遗传学是连锁交换规律,建立了遗传的染色体学说,为细胞遗传学奠定了重要基础。并由此提出基因既是一个功能单位,是一个突变单位,也是一个交换单位的“三位一体”概念。∴ 经典遗传学认为:基因是一个最小的单位,不能分割;既是结构单位,又是功能单位。 基因的类别及其相互关系 根据基因的功能和性质,可将其分为以下几类: (一)结构基因(structural gene)和调节基因(regulatory gene):既可转录又可翻译。 (二)核糖体RNA基因(rRNA基因简称rDNA)和转移RNA基因(tRNA基因简称tDNA ):只可转录不可翻译。前者专门转录rRNA, rRNA与响应蛋白质结合形成核糖体;后者专门转录tRNA, tRNA作用是激活氨基酸。 (三)启动子(promotor)和操纵基因(operator):既无转录功能又无翻译功能,确切说,它们不能称为基因。 基因与DNA 一个基因大约有500-6000个核苷酸对,但并非DNA分子上任一含有几千个核苷酸对的区段都是一个基因,基因是一个含有特定遗传信息的DNA分子区段。 如何判断一段核苷酸序列是否是某个基因? 要看这个特定的核苷酸序列是否与其转录产物RNA核苷酸序列或翻译产物多肽链的氨基酸序列相对应,这样就必须同时测定某一段DNA的核苷酸序列和相应产物的序列。 互补测验 一、互补测验的原理和方法 互补测验(顺反测验):根据功能确定等位基因的测验。即根据顺式表现型和反式表现型来确定两个突变体是否属于同一个基因(顺反子) 彼此互补(complementation):用 rⅡ 突变型成对组合同时去感染大肠杆菌K(λ)株,若被双重感染的细菌中产生两种亲代基因型的子代噬菌体(也有少量重组型的噬菌体),那么就必定是一个突变型补偿了另一个突变型所不具有的功能,这两个突变型就称为彼此互补。 4.2 基因命名法 (一)基因家族(gene family) 2、复杂多基因家族 复杂多基因家族一般由几个相关基因家族构成,基因家族之间由间隔序列隔开,并作为独立的转录单位。现已发现存在不同形式的复杂多基因家族。?? 断裂基因 基因的编码序列在DNA分子上是不连续的,为非编码序列所隔开,其中编码的序列称为外显子,非编码序列称内含子。 1、外显子与内含子的连接区 指外显子和内含子的交界或称边界序列,它有两个重要特征: 内含子的两端序列之间没有广泛的同源性 连接区序列很短,高度保守,是RNA剪接的信号序列 5GT——AG 3 2、外显子与内含子的可变调控 组成型剪接:一个基因的转录产物通过剪接只能产生一种成熟的mRNA。 选择性剪接:同一基因的转录产物由于不同的剪接方式形成不同mRNA。 假基因 人类基因组计划 人类基因组计划(Human genome project)于1990年启动,我国于1999年加入该计划,承担其中1%的任务,即人类3号染色体短臂上约30Mb的测序任务。 人类基因组计划的目的 阐明人类基因组30亿个碱基对的序列,发现所有人类基因,并搞清其在染色体上的位置; 破译人类全部遗传信息,使人类第一次在分子水平上全面地认识自我; 解码生命、了解生命的起源、了解生命体生长发育的规律; 认识种属之间和个体之间存在差异的起因、认识疾病产生的机制以及长寿与衰老等生命现象、为疾病的诊治提供科学依据。 人类基因组草图的完成 2000年6月26日是人类历史上值得纪念的一天。人类基因组的工作草图已经绘制完毕并于这天向全世界公布。最终完成图要求测序所用的克隆能忠实地代表常染色体的基因组结构,序列错误率低于万分之一。 A. Celera Genomics 人类基因组的测序策略 B 国际人类基因组测序策略 构建BAC克隆 ↓ 限制性酶处理获得指纹 ↓ 根据指纹重叠方法组建BAC克隆重叠群 ↓ 根据STS标记,将BAC克隆重叠群标定在物理图上 ↓ 每个BAC克隆内部采用鸟枪法测序,组装 ↓ 将BAC插入顺序与BAC克隆指纹极重叠群对比,将已阅读的顺序锚定到物理图上 人类基因组研究的惊人发现 什么是单核苷酸多态性 人类99.9%的基因密码是相同的,而差异不到0.1%,不同人群仅有140万个核苷酸差异。
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