从零学测序癌症基因组重测序分析第六讲之circos图的绘制.pptVIP

【测序中国-从零学测序】癌症基因组重测序分析第六讲之circos图的绘制;Circos?是一个Perl语言开发的自由可视化软件，使用GPL协议分发，以绘制输出圈图(原型 Circos 是由加拿大的一位生物信息科学家 Martin Krzywinski 所开发，他同时是一位专业摄影师，最初他主要从事Linux系统管理等工作风格的图)为最大特色;Circos案例;Circos绘图流程;Windows上安装Circos;Unix上安装Circos;配置语法：变量名=变量值 配置块： ; 在circos/etc目录下有些现成的设置会经常用到，从不或很少改变，学会运用这些配置文件对学习circos有很大帮助，也省去了很多麻烦，如colors.conf、fonts.conf等。写配置文件的时候可以直接导入使用。; 还有一些设置是也是经常用到，但会根据个人喜好或绘图要求不同而有细微差别，如ideogram.conf、 ticks.conf等。除此之外，也可以把经常用到的设置写成配置文件，便于其它配置文件反复导入，提高效率。; 对于上述提到的那些配置文件，主配置文件可以用include xxx.conf来导入，这样在主配置文件中就不必再对xxx.conf文件中的变量进行定义了。如此一来，既可以使这些重要配置文件得以重复利用，也大大简化了主配