第三十六章-DNA转录.pptVIP

转录的起始 RNA聚合酶与dsDNA非特异性结合 RNA 聚合酶全酶与启动子形成封闭复合物 封闭复合物异构化，转变成开放复合物 第一个磷酸二酯键形成 启动子清空 细菌基因转录从起始阶段向延伸阶段的转变 RNA聚合酶催化磷酸二酯键形成的反应机制 RNA聚合酶催化1个磷酸二酯键形成以后面临的3种选择 转录的延伸 一旦σ因子释放，转录就进入延伸。失去σ因子的核心酶通过松散的“滑动钳”构象握住DNA，以更快的速度前进。转录泡则随着核心酶的移动而移动，其大小维持在17 bp左右。解链形成的超螺旋可被结合在转录泡前面的拓扑异构酶解除。由于转录的方向始终是从5′→3′，新参入的核苷酸总是被添加在RNA链的3′-OH端。每参入一个新的核苷酸，RNA-DNA杂交双链必须发生旋转。 在延伸阶段，RNA链3′端大约有9 bp长的片段与模板链形成A型杂交双螺旋。延伸的平均速度约为50nt/秒。但延伸速度并不是恒定的，有时聚合酶的移动速度趋缓，甚至发生暂停。如果发生这种情形，重新启动转录需要GreA和GreB来解除暂停状态：先是RNA聚合酶倒退，然后，GreA和GreB切除 3′端几个核苷酸，以便让RNA的3′-OH能重新回到活性中心。 转录延伸和转录泡的结构 两种机制 依赖于ρ因子的终止 不需要ρ因子，但需要RNA转录物3′-端一段被称为终止子的序列。 转录的终止 不需要ρ因子的终止机制 依赖ρ因子的转录终止 细菌和真核生物在转录上的差别 染色质和核小体结构对转录有深刻的影响 真核细胞RNA聚合酶高度分工 转录还需要许多被称为转录因子的蛋白质的参与 启动子以外的序列参与调节基因的转录 转录与翻译不存在偶联关系 转录的产物多为单顺反子，而原核基因的转录产物多为多顺反子 增强子的性质 增强子作用的环出模型 其他顺式作用元件 ERE——雌激素反应元件 HSE——热激元件 MRE——金属反应元件 GRE—— 糖皮质激素反应元件 CRE——cAMP反应元件 SRE——血清反应元件 RNA聚合酶I所负责的基因的转录 启动子 1) 核心启动子 (-45 to +20) 2) 上游控制元件 (UCE; -180 to -107) UCE和核心启动子之间的距离十分重要；具有物种特异性 转录因子 1) SL1: TBF+TAF 2) UBF 转录的起始、延伸 转录终止——需要一种特异性的DNA结合终止因子 RNA聚合酶I负责的基因的启动子结构以及与转录因子的结合 RNA聚合酶III所负责的基因转录 该酶负责小RNA的转录，如tRNA、5S rRNA、7S RNA、snoRNA和无帽子结构的snRNA和某些病毒的mRNA等。 启动子分为两类：一类与RNA聚合酶II相似，也位于基因的上游；另一类为内部启动子。 转录因子有TFIIIA、B和C。其中TFIIIC为组装因子，负责与A盒和B盒结合。TFIIIB是定位因子，结合于A盒的上游约50bp的位置，但结合无序列特异性。TFIIIA仅为5S rRNA基因的转录所必需的组装因子。 转录的起始和延伸 转录的终止——与细菌不依赖于ρ因子的终止机制有点相似，需要1段富含GC的序列和1小串U，但U的长度短于细菌，且富含GC区域也不需要形成茎环结构 由RNA 聚合酶Ⅲ催化转录的基因的启动子结构 tRNA 基因转录的起始和延伸 RNA聚合酶II所负责的基因转录 催化mRNA、miRNA、具有帽子结构的snRNA和某些病毒RNA的基因转录。 mRNA的基因转录受到多种顺式作用元件的控制，包括核心启动子、调控元件、增强子和沉默子。 核心启动子功能与细菌的启动子相当，负责招募和定位聚合酶II到转录起始点，以正确地起动基因的转录，也可能通过促进转录复合物的装配或稳定转录因子的结合而提高转录的效率。 核心启动子包括：TATA盒、起始子（Inr）、TFIIB识别元件（BRE）、下游启动子元件（DPE）和GC盒。 调控元件所起的作用是调节基因的转录效率，包括上游临近元件（UPE）和上游诱导元件（UIE），两者的作用都需要结合特殊的反式作用因子。 参与蛋白质基因转录的转录因子有两类，一类为基础转录因子，另一类属于特异性转录因子。前者为所有的蛋白质基因表达所必需，后者为特定的基因表达所必需 转录的起始是各转录因子和RNA聚合酶II按照一定次序，通过招募的方式形成PIC。转录因子和聚合酶II与启动子结合的前后次序可能是：TFIID→TFIIA→TFIIB→(TFIIF + RNAP II) →TFIIE→TFIIH。 转录终止于一段终止子区域，但终止子的性质以及它如何影响终止的尚不知晓 真核生物RNA聚合酶II的启动子序列 RNA聚合酶II的基础转录因子 转录因子 亚基数目 功能 TFIID 1TBP