巨桉纤维素合酶Ces家族的生物信息学分析.pdf

广 东 林 业 科 技　２０１４年第３０卷第２期 １５ 巨桉纤维素合酶Ｃｅｓ家族的生物信息学分析 徐　双　　曾炳山　　范春节　　刘　英　　李湘阳　　裘珍飞 （中国林业科学研究院热带林业研究所，广东 广州５１０５２０） 摘要　纤维素合酶（Ｃｅｌｌｕｌｏｓｅｓｙｎｔｈａｓｅ，Ｃｅｓ）基因家族成员负责催化纤维素的合成。利用Ｐｈｙｔｏｚｏｍｅ网站 对巨桉（Ｅｕｃａｌｙｐｔｕｓｇｒａｎｄｉｓ）全基因组序列进行检索，共发现３１条蛋白质序列属于Ｃｅｓ家族，其中包括 １８个 ＣｅｓＡ亚族成员与１３个ＣｓｌＤ亚族成员。使用ＣｌｕｓｔａｌＷ、Ｐｒｏｔｐａｒａｍ、ＴＭＨＭＭ等生物学在线服务器，对巨桉３１ 个Ｃｅｓ家族成员进行全面生物信息学分析预测，结果显示：３１条蛋白质序列均具有Ｃｅｌｌｕｌｏｓｅｓｙｎｔｈａｓｅ特征性 保守结构域，具有Ｃｅｓ家族成员特征；巨桉Ｃｅｓ家族与拟南芥Ｃｅｓ家族、杨树Ｃｅｓ家族在亚族种类、成员组成、 蛋白理化性质方面存在变异性；蛋白结构域、二级结构、跨膜区预测、无序性、亚细胞定位分析结果存在保守 性。 关键词　巨桉；纤维素合酶家族；生物