矿物风化细菌的生物学特性和Dyella+jiangningensis+SBZ3-12全基因组分析.pdfVIP

矿物风化细菌的生物学特性和Dyella+jiangningensis+SBZ3-12全基因组分析.pdf

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-_。-_____-●__-__________-______●-_-__-。-___-。__。’I_-。_。。。。。。。。。。。。-_-●--。。。_-’——————’————————————————一一一 一..笙塑垦些塑堕坐丝坐竺竺塑壁竺堡!里兰!:!!全茎里丝型壁垦些簦茎里丝坌塑 3结果与分析……………………………………………………………………………………….26 3.1菌体形态观察……………………………………………………………………………一26 3.2菌株的生理生化特性……………………………………………………………………..26 3.3菌体极性脂类成分分析…………………………………………………………………..28 3.4全细胞脂肪酸成分分析…………………………………………………………………..29 3.5菌体醌型分析……………………………………………………………………………一30 3.6细菌16SrRNA基因序列分析……………………………………………………………30 G+C l 3.7细菌DNAm01%含量测定…………………………………………………………3 3.8DNA.DNA同源性测定……………………………………………………………………32 4讨论………………………………………………………………………………………………….32 5本章小结………………………………………………………………………………………….33 SBZ3.12全基因组deIIOVO测序………………………………………35 第三章Dyellajiangningensis 1材料……………………………………………………………………………………………………………………一35 1.1供试菌株…………………………………………………………………………………一35 1.2培养基与试剂……………………………………………………………………………一35 2方法……………………………………………………………………………………………………………………………….36 SBZ3.12的培养与基因组DNA抽提………………………….36 2.1菌株D.jiangningensis 2.2基因组DNA纯度检测……………………………………………………………………37 2.3基因组文库构建…………………………………………………………………………一38 2.4基因组序列测定与序列拼装……………………………………………………………一43 2.5基因组补洞………………………………………………………………………………一44 2.6基因组数据格式化及GenBank数据库提交…………………………………………….45 3结果与分析……………………………………………………………………………………….45 SBZ3—12的培养和基因组DNA的抽提……………………….45 3.1菌株D.jiangningensis 3.2基因组DNA纯度检测……………………………………………………………………46 3.3基因组文库构建…………………………………………………………………………一47 3.4基因组序列测定与序列拼装……………………………………………………………一47 3.5基因组补洞…………………………………………………………………………………48 3.6基因组数据格式化及GenBank数据库提交…………………………………………….48 4讨{仑……………………………………………………………………………………………………………………………….48 5本章小结………………………………………………………………………………………….50

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