02第2章遗传图绘制20110905.pptVIP

第2章 遗传图绘制 基因组计划基本目标是获得全基因组顺序，在此基础上再对序列进行解读。获取基因组顺序的主要方法是进行DNA测序，然后再将读取的顺序组装。目前的DNA测序每次反应仅能读取不到1 000bp的长度，已知最小的细菌基因组为580kb。因此基因组测序的第一步是构建基因组图，然后将基因组区段分解逐个测序，最后进行组装。基因组作图的基本构想是，在长链DNA分子的不同位置寻找特征性的分子标记，根据分子标记将包括这些序列的克隆进行连锁定位，绘制基因组图。一旦构建好基因组图，即可着手进入全基因组测序。以基因组图指导的测序有二种可供选择的路线(图2.1)： 克隆(clone)定义 一个共同前体通过无性繁殖而形成的一群基因结构相同的细胞或个体。(组培) 基因克隆，则指一个基因反复扩增后产生的多个拷贝。 动名词(cloning)即指获得克隆的过程或手段。 利用体外重组技术将某特定的基因或DNA序列插入载体分子的操作过程。 1. 重叠克隆群法 构建过程： DNA测序不能从染色体进行，首先必须克隆化。先构建片段DNA克隆(以YAC或BAC为载体)，并把克隆依染色体排序，这就是“染色体的克隆图”。依片段DNA克隆在染色体上所在的位置排序，可以得到相互重叠的一系列克隆，叫做“克隆重叠群” (contiguous series of overlapping clones, C